MCFC的结构示意图如图2所示。MCFC组装方式是：隔膜两侧分别是阴极和阳极，再分别放上集流板和双极板。MCFC电池组的结构如图3所示。按气体分布方式可分为内气体分布管式（a）和外气体分布管式（b）。外分布管式电池组装好后，在电池组与进气管间要加入由LiAiO2和ZrO2制成的密封垫。由于电池组在工作时会发生形变，这种结构导致漏气，同时在密封垫内还会发生电解质的迁移。鉴于它的缺点，内分布管式逐渐取代了外分布管，它克服了上述的缺点，但却要牺牲极板的有效使用面积。在电池组内氧化气体和还原气体的相互流动有三种方式：并流、对流和错流。
