成立后的中心为市政府直属事业单位，实行市以下垂直管理。中心按照市编委会《关于调整白银市住房公积金管理体制的通知》（市编字〔2003〕6号）规定，内设综合科、计划科、核算科和信贷科四个科，下设景泰、靖远、会宁、平川四个管理部及靖远煤业有限责任公司分中心。（1）编制、执行住房公积金的归集、使用计划，编制计划执行情况的2009年，依据《关于调整市住房公积金管理中心内设机构的通知》（白编字〔2009〕24号）文件内容，中心增加了营业部、审计稽核科、计算机室三个科室。调整后内设机构为：办公室、归集管理科、贷款管理科、核算科、审计稽核科、计算机室、营业部。下设机构为：会宁管理部、靖远管理部、景泰管理部、平川管理部。
