根据2020年7月官网显示，长江科学院在职职工800余人，其中专业技术人员700余人，教授级高工及高级职称人员480余人，博士230余人，硕士290余人。有“双聘院士”2人、享受国家政府特殊津贴专家4人、国家百千万人才工程国家级人选2人、万人计划青年拔尖人才1人、水利部“5151”人才工程部级人选4人、享受湖北省政府津贴专家4人、湖北省突出贡献专家2人、湖北省重大人才工程“高端人才引领培养计划”首批培养人选1人、 湖北省新世纪高层次人才工程第一层次人选1人、水利部青年科技英才1人、中国科协青年人才托举工程及中国水利学会青年人才助力计划5人、湖北省青年英才开发计划1人。
中国工程院院士（2人）：郑守仁（双聘）、钮新强（双聘）
“百千万人才工程”国家级人选：（2人）：丁秀丽、杨文俊
国家“万人计划”青年拔尖人才（1人）：汤显强
享受国务院政府特殊津贴专家（4人）：丁秀丽、卢金友、邬爱清、杨文俊
湖北省有突出贡献中青年专家（2人）：林绍忠、程展林
湖北省政府专项津贴专家（4人）：卢金友、汪在芹、陈进、范北林
湖北省高端人才引领培养计划首批第一层次培养人选（1人）：陈进
水利部水利科技英才（1人）：姚仕明
水利部“5151”人才工程部级人选（4人）：卢金友、杨文俊、汪在芹、黄国兵
湖北省新世纪高层次人才工程第一层次人选（1人）：姚仕明
长江委重大成就奖获得者（7人）：卢金友、李青云、汪在芹、张平仓、陈进、林绍忠、贾宝良
中国爆破行业有突出贡献科技专家（2人）：吴新霞、赵根
第二批湖北省青年英才开发计划（1人）：周银军
中国科协青年人才托举计划入选者（4人）：林莉、赵瑾琼、胡英国、袁喆
“5151人才工程”第三、第四层次人选（37人）：丁文峰、丁秀丽、王志旺、王敏、尹正杰、甘孝清、石妍、卢波、朱杰兵、朱勇辉刘美山、刘洪鹄、汤显强、李青云、李珍、李家正、李喆、李端有、张平仓、张奇华张细兵、张家发、陈进、陈亮、林莉、周火明、赵伟华、赵根、胡波（土保所）、黄书岭、黄茁、曹慧群、董芸、韩炜、程冬兵、谭德宝、潘家军
湖北省新世纪高层次人才工程第三层次人选（11人）：王家生、邢领航、刘纪根、许继军、李学海、张细兵、陈端、胡波（岩土重点实验室）、段文刚、黄茁、常福宣
根据2020年7月官网显示，长江科学院下设16个研究所（中心），1个分院，1个科技企业，3个综合保障单位。此外，依托长科院组建了江湖保护与水安全保障国际科技合作基地、国家引才引智示范基地。长江治理与保护科技创新联盟秘书处和长江技术经济学会秘书处设在长科院。
国家级研究中心：国家大坝安全工程技术研究中心
省部级重点实验室：水利部江湖治理与防洪重点实验室、 水利部岩土力学与工程重点实验室、流域水资源与生态环境科学湖北省重点实验室
省部级研究中心：水利部水工程安全与病害防治工程技术研究中心、水利部山洪地质灾害防治工程技术研究中心、水利部科技推广中心长江科技推广示范基地
地市级研究中心：武汉市智慧流域工程技术研究中心
所属研究机构：河流研究所、水资源综合利用研究所、水土保持研究所、流域水环境研究所、空间信息技术应用研究所、工程安全与灾害防治研究所、农业水利研究所、国际河流研究所、水力学研究所、材料与结构研究所、岩基研究所、土工研究所、爆破与振动研究所、重庆科学实验研究中心、工程质量检测中心（计量检定及标准化中心）、野外科学观测中心（生态修复技术中心）、科技成果推广中心
根据2020年7月官网显示，长江科学院总占地面积近90万平方米，在武汉、宜昌、重庆、青海杂多等地建有科研基地，其中武汉的沌口科研基地占地约40万平方米，建有世界规模最大的河工模型——长江防洪模型，拥有各类实体模型试验大厅，拥有先进的仪器设备4000余台（套）。
