（一）办公室（行政审批科）
综合协调各科室工作，负责文电、机要、保密、档案、宣传、政务信息、绩效考核、综治维稳、治安消防、督查督办、目标管理等工作；组织办理人大、政协有关议案和提案；负责重要会议和接待工作；负责局机关内部规章制度建设和思想政治工作。组织水利新技术引进、推广和管理工作；承担涉水行政审批工作，负责机关人事管理、机构编制、劳动工资工作；会同有关部门组织水利行业教育培训、职称评定、职业技能鉴定工作；负责局党组办公室日常工作；负责接待、处理群众来信来访工作；协调处理突发性群体事件；负责机关离退休人员工作。
（二）财务与经济计划科
编制部门预决算和全州水利行列财务中长期规划和年度计划，实施财务、会计和专项经费的综合管理；承担水利资金和国有资产的监督管理工作；协调和衔接水利行列资金；负责财务、国有资产、行政事业性收费和领导干部经济责任的审计监督；
（三）规划计划科
承担水利发展及涉水规划计划工作。拟订水利战略规划，组织编制重大水利综合规划、专业规划和专项规划；组织编制全州水利中长期发展规划；编制和审查专业规划并监督实施；安排年度水利建设设计划，编制水利工程项目建议书、可研报告和初步设计并承办初审转报工作；实施行业技术、质量标准和规程规范；负责水利行业综合统计工作。
（四）水利科
指导农田水利基本建设、乡镇集中供水、农村饮水安全、节水灌溉等工程建设与管理工作；审核重要水利工程的初步设计；指导水利工程招标投标、建设监理、质量监督工作和重点水利工程的验收，审核水利建设项目的项目建议书、可行性研究报告，承担水利综合统计工作。
（五）水政水资源科
统一管理全州水资源，组织实施取水许可、水资源有偿使用制度；组织水资源调查、评价和监测工作；拟订水量分配、水功能区划和水资源调度方案并监督实施；审核重要水功能区的水域纳污能力，指导、监督建设项目入河排污口设置，提出限制排污总量的建议，指导和推动节水型社会建设工作；指导全州水文水资源监测，发布全州水资源公报；负责全州水产渔政和普法工作； 指导全州水政监察工作；负责行政复议、行政应诉、行政赔偿和行政调解工作；负责机关规范性文件的合法性审查工作。
（六）水土保持科
承担水土流失综合防治工作；负责全州水土保持预防监督工作；组织指导全州水土流失监测和综合防治工作；负责全州城市（镇）水土保持工作，监督建设项目水土保持方案实施工作；指导水土保持项目的建设、管理和竣工验收；对水土保持法律法规的执行情况进行监督实施；管理、使用水土保持资金和物资；收缴水土流失防治费和水土保持设施补偿费，查处水土保持违法行为；组织开展水土保持技术推广工作。
（七）农村电力与安全生产科
指导农村水能资源开发、水电农村电气化和小水电代燃料工作；审批限额内、转报限额以上城乡水电站及输变电站工程项目建议书、可行性研究报告和初步设计；协调城乡电站、输变电工程基本建设的招投标、概预算管理、施工安全、工程竣工验收等工作；负责农村安全用电管理；承担水利行业安全生产工作，负责全州涉水工程的安全工作，组织实施水利工程质量和安全监管；协调重大水利安全事故的调查处理。
（八）建设管理科
负责全州水利工程基本设项目的建设与管理，负责水利工程设项目招标管理，承办大中型水利项目的初审转报工作，组织重点水利工程项目的建设、管理和验收；组织指导河道、水库、湖泊（包括人工水道、行洪区、蓄水区、滞洪区）和河口滩涂的治理，负责河道管理范围内采砂管理工作，负责河道管理范围内建设项目评估审查。
（九）水政监察支队
制订行政执法工作安排、水政执法巡查计划、行政调解工作、依法行政工作安排；参与水事纠纷的调查、调解、协调工作,参与县际水事纠纷调处；对本行政辖区水事活动进行监督检查，查处水事违法行为，协助公安和司法部门查处水事治安和刑事案件；协助相关业务科室受理；办结水事违法案件，负责重大涉水违法事件的查处；负责管理、培训、考核水政监察员工作，对县水政监察大队进行指导和监督；负责行政权力平台数据的录入、绘制外部和内部流程图、设置监察点和廉政风险防控措施、平台试运行、审件平台运行；开展依法行政工作及绩效考核工作 ；开展行政调解工作。
（十）水利电力安全与质量监督站
办理水利工程质量监督机构办理监督手续；制订质量监督计划，确定质量监督的组织形式；对水利工程现场服务等实施监督检查；对中型、重点工程项目的单位工程、分部工程、单元工程的划分和质量评定进行确认；监督检查技术规程、规范和质量标准的执行情况；检查施工单位和建设、监理单位对工程质量检验和质量评定情况；对工程质量进行等级核定，编制工程质量评定报告，并向工程竣工验收委员会提出工程质量等级的建议；上报省水利工程建设项目质量监督情况季度报表。
（十一）州防汛抗旱指挥部办公室
贯彻执行国家有关防汛工作的方针、政策和法规；了解、掌握和分析气象、雨情、水情、汛情、灾情、险情、工情及其变化情况，及时向省防办和州人民政府报告并提出处理意见；下达防汛抗旱指挥部的决策和指令；组织、协调部队和其他抢险救灾队伍的防洪抢险和抗旱救灾工作；组织防汛安全大检查；督促险工段的处理及水毁工程的修复；组织制订防御特大洪水方案和应急措施；组织审定水电站水库防限水位、河道堤防警戒水位，并监督运用计划的执行；配合做好河流和水电站水库的防洪调度工作；组织做好灾情统计、评估以及资料调查和整编；负责防汛经费、物资的计划、调配与管理；组织建立、健全防汛通讯制度和州防汛抗旱指挥系统，推广、应用先进技术；组织有关人员的学习培训，开展防汛抗旱宣传工作；做好防汛工作总结和资料汇编，推广防汛工作先进经验；对重大防洪预案的审查。
（十二）水利水电勘测设计所（自收自支生产经营性事业单位）
负责全州范围内的水利、水电项目总体规划，可行性研究报告，地质勘查、测绘工作，工程设计工作，涉及方案进行审查、论证。
