处理室有间歇式及连续式两种，连续式可工业化生产。物料在处理室内受到高电压脉冲作用时，要避免有气泡，否则有电火花产生。一旦产生电火花电极就会被腐蚀，物料被电解。因此，在设计处理室时，应着重解决好以下问题:电极表面要尽可能光滑以减少电子的逸出，采用圆形电极以避免电场集中，为物料提供一个均匀的高电压脉冲电场。 图1为物料处理室结构简图，处理装置的上下两端进出料端子为不锈钢，通过导电板一端接高电压脉冲电源，另一端接地，绝缘体材料选用聚异丁烯酸树脂。由于绝缘体中心孔内液体食品的电阻远大于其他部分的电阻，所以在绝缘体中心孔形成集中电场，其电场强度远大于其他部分电场强度。因此，绝缘体中心孔区是提取区域。电极附近的电压相对较低，这样就起到了保护电极的作用。
管路的进、出口都放在超净工作台中，采用如图2所示的高电压脉冲电场处理装置，样液流动方向如图2箭头方向所示，温度传感器可显示物料进出处理室的温度，并可通过泵送流过恒温(温度可设)水浴，进入处理室，同时经高压脉冲电场(通过进出料端子将高压脉冲电压施加到处理室上)作用后，经水浴流入收集容器。
