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设有三个重点研究领域：沙漠大气环境、气候变化与绿洲冰雪环境、资源与信息技术。该所在沙漠大气、陆—气相互作用、水热循环、农牧业气象、树木年轮气候研究以及卫星遥感技术应用、天气预报研究等方面具有鲜明的专业优势和区域特色。研究所的任务是以应用基础和应用研究为主，以沙漠大气及其周边地区气候变化与荒漠生态环境问题为研究对象，主要开展沙漠、绿洲、冰雪不同下垫面的大气物理过程以及农牧业气象、树木年轮气候、天气预报、卫星遥感技术和自然灾害等方面的研究和相关的业务服务。
