协会自2002年6月成立以来，不断发展壮大，协会现有秘书处、实践部、外联部、网宣部、义工部和环教部六个部门，成员共100余人。

中国海洋大学环境保护协会秘书部

管理环协的财务和物资，编写策划和活动总结，管理成员档案。

中国海洋大学环境保护协会实践部

承办协会内各种志愿实践类活动，包括全国水果贺卡、地球一小时等。

中国海洋大学环境保护协会外联部

环协与全国各大高校环保社团的联系与向企业寻求合作，拉取赞助。

中国海洋大学环境保护协会网宣部

责利用线上（如新浪微博、微信公众号及各大环保网站）和线下多种渠道，全方位宣传环协各大环保活动，例如品牌活动T恤义卖。

中国海洋大学环境保护协会义工部

负责组织管理青岛市慈善总会注册义工队-“海大环协慈善义工队”，在校内招募义工，带领义工团队参与青岛市的各种义工志愿活动。

中国海洋大学环境保护协会环教部

定期在环协环保教育基地（如李沧区实验小学和铜川路小学）举办环教及向海大校内学生开展环保教育，普及环保知识。现已面向全校招收了大量环教会员，会员属于海大环协慈善义工队，由环教部负责环教会员的管理。环教部及会员隶属于青岛慈善总会。