直属车站4个：乌鲁木齐站、乌鲁木齐南站、霍尔果斯站、阿拉山口站；
车务段6个：乌鲁木齐车务段、哈密车务段、库尔勒车务段、奎屯车务段、阿克苏车务段、喀什车务段；
客运段2个：乌鲁木齐客运段、库尔勒客运段；
机务段3个：乌鲁木齐机务段、库尔勒机务段、哈密机务段；
供电段3个：乌鲁木齐供电段、库尔勒供电段、哈密供电段；
工务段6个：乌鲁木齐工务段、乌鲁木齐北工务段（现并入乌鲁木齐工务段）、哈密工务段、奎屯工务段、库尔勒工务段、阿克苏工务段、喀什工务段；
工务机械段1个：乌鲁木齐工务机械段；
车辆段3个：乌鲁木齐车辆段、乌鲁木齐西车辆段、库尔勒车辆段；
电务段3个：乌鲁木齐电务段、库尔勒电务段、哈密电务段；
通信段1个：乌鲁木齐通信段；
物资供应段1个：乌鲁木齐物资供应段；
房产公寓段3个：乌鲁木齐房产公寓段、哈密房产公寓段、库尔勒房产公寓段；
