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水分亏缺影响生长的直接原因是细胞膨压和原生质的水合程度降低使细胞不能增大和正常分裂；间接原因是气孔阻力增大，光合所需二氧化碳的供应降低，有机物质的积累减少。此外，水分亏缺还影响作物对无机离子的吸收和对物质的运输，并影响许多生化反应，例如组织内碳水化合物的降解（有机化合物转换成碳原子数较少的化合物的过程）和外运加强，氨基酸和蛋白质的合成受阻，叶中脱落酸含量增多等。水分亏缺亦因抑制蒸腾而减少植株体散热量，导致叶与枝体过热。这些均对作物的生长产生不良的影响 。
