根据上述职责，周宁县国土资源局设6个内设机构。

（一）办公室

综合协调局机关和直属单位工作，督促重大事项的落实；承担局机关文电、会务、机要、档案、保密、信息、信息化、效能、安全、保卫、政务公开、新闻宣传等工作；负责局机关内部规章制度建设、政风行风建设、民主评议、精神文明、综治、计生等工作，管理局机关国有资产和行政事务等。拟定部门财务会计制度和办法，规范部门财务管理行为；编制本部门预、决算和各项经费使用计划；对所属事业单位的财务及国有资产监督管理，实现国有资产的保值和增值；承担国家财政拨给的各项资金财务管理任务；对国土资源管理的各项收益和行政事业收费进行财务监督管理。负责局机关和直属单位机构编制、人事管理等工作；负责国土资源系统教育培训工作；组织直属单位专业技术资格评定工作；负责国土资源系统科技工作；负责国土资源系统外事工作；负责退休干部工作。

（二）法规监察股

组织实施国土资源管理的有关规范性文件；承办行政复议和行政应诉等工作；承担政策法规的咨询和宣传工作；承担局机关有关规范性文件的合法性审核工作，推进国土资源系统依法行政工作；监督检查国土资源法律法规执行情况；拟订国土资源执法监督和案件查处的有关规定；依法组织查处县级管辖的国土资源违法案件；承担国土资源信访工作；协助管理国土资源执法监察队伍。

（三）地籍与规划测绘管理股

承担全县城乡地籍管理工作；组织和指导全县土地资源调查、地籍调查、土地统计及土地利用动态监测工作；及时准确提供全县土地利用现状数据；负责规范全县土地权属管理（不含林木林地权属管理）；负责全县土地确权、登记、发证工作；组织承办调处重大土地权属争议；承担各类土地登记资料的收集、整理、共享和汇交管理，提供社会查询服务；负责城乡地籍信息系统建设工作。会同有关部门组织编制全县土地利用总体规划、基本农田保护、耕地开发、土地整理、土地复垦等专项规划；参与城市规划等其它专项规划的审核；承担基本农田保护和耕地保护责任目标考核的有关工作，监督检查基本农田保护和占用耕地补偿制度落实情况；负责全县国土资源综合统计工作，及时通报有关信息。

负责测绘地理信息管理工作，制定测绘地理信息事业发展规划；负责组织实施管理基础测绘、地籍测绘、行政区域界线测绘、城乡测绘和其它重大测绘项目；负责对使用财政性资金的测绘项目、建设工程测绘项目批准立项和核定财政补助金之前的审核工作；负责测绘地理信息标准、质量的监督管理工作；负责管理测绘资质单位；监管测绘地理信息市场活动；承担提供测绘地理信息公共服务和应急保障测绘责任；负责测绘成果的监管和测量标志保护工作承担地图管理的责任；负责测绘地理信息工作综合统计、汇总和上报工作。

（四）建设用地管理股

指导农用地转用、土地征收征用工作；编制年度用地计划；承办省政府和国务院批准的全县各类农用地转用和征收征用的审查、汇总、报批工作；参与大中型建设项目用地的前期工作；组织发布农用地转用、土地征收的各类信息；组织、指导征地听证工作，配合有关部门做好被征地农民养老保障工作；跟踪落实征地补偿费发放；承担农村村民住宅农用地转用审批工作；跟踪检查各类建设项目土地利用情况。负责土地市场管理工作；编制全县年度供地计划；指导全县国有土地使用权招标、拍卖、挂牌工作；参与基本建设项目可行性研究的审核；负责具体建设项目供地方案的审查工作，组织发布各类建设用地信息；负责农村集体非农建设土地使用权流转的管理。负责节约集约用地评价和建设用地分等定级；指导基准地价、标定地价的评估及公布,负责土地评估报告备案工作；组织建设项目用地的批后管理和验收；指导和监督乡(镇)、村土地利用管理工作；负责土地资源实行资产化管理的有关工作。

（五）矿产开发与地质环境股

会同有关部门组织编制全县矿产资源开发利用等专项规划；编制实施采矿权设置方案，管理采矿权市场；监管矿产资源开采活动，调处较大采矿权属争议、纠纷；承担矿产资源补偿费征收。负责全县矿产资源储量登记管理和矿山储量动态监督管理工作，以及建设项目压覆重要矿产资源的审查工作。会同有关部门组织编制全县年度地质灾害防治方案及专项规划；组织、协调、指导和监督全县地质灾害防治工作,起草并组织实施突发性地质灾害应急预案,指导全县地质灾害监测、预报工作；负责全县建设用地地质灾害危险性评估报告的审查、备案；负责全县矿山地质环境保护工作；承担全县古生物化石、地质遗迹、矿业遗迹等较重要保护区、保护地的监督管理工作；依法管理水文地质、工程地质、环境地质、城市地质、农业地质、旅游地质勘查和评价工作。协助管理地质勘查行业、地质勘查资质、地质资料、地质勘查成果，统一管理全县公益性地质调查；审查探矿权设置有关要件，配合调处探矿权属争议、纠纷。

（六）行政审核审批股

负责县级审批权限内所有报件受理申请，包括各类建设项目用地预审申请和使用国有土地、临时用地、个人住宅用地申请；承担国有土地使用权划拨、出让、转让、租赁、作价出资、抵押申请；负责采矿权审核、审批登记发证申请；组织相关股室对有关事项实施会审，负责上述受理报件的转报、审核、审批。