保护级别：列入《世界自然保护联盟濒危物种红色名录》（IUCN）2013年 ver 3.1——无危（LC）。 列入《中国生物多样性红色名录-高等植物卷》2013年9月2日——近危。
物种现状：渐危种。在中国间断分布于吉林、辽宁两省毗邻的山区和华东及华南某些省的局部山区。由于森林砍伐，生境被破坏以及天然更新能力较弱等原因，分布区域日益缩小，植株越来越少。
保护措施：分布区内已建有黄山、清凉峰、梵净山、凤阳山、武夷山等自然保护区，应将小花木兰列为保护对象。产区有关单位应引种栽培，扩大种植。中国杭州植物园已引种保存。
