宁都县水利局位于梅江镇博生西路55号。最初的水利工作由县人民政府建设科兼管。1953年12月设立水利科,1955年12月成立农林水利局,1956年7月设立水利局,1960年12月与农业局合并成立农业水利局,1963年成立水利电力局,2003年更名为水利局。为县政府主管水政水资源、防汛抗旱、水利水电工程及其建设的职能部门。
宁都县水利局内设办公室、水政水资源股、计划财务股、水利工程建设与管理站、农村水利站、水利水电勘测设计院、监察室。县防汛抗旱指挥部办公室为局正科内设机构。局机关共有干部职工60人。技术人员取得高级职称2人,中级职称11人,初级职称9人。属局单位3个,24个乡镇水管站共有水利员59人。