1．办公室（规划财务股） 负责处理机关日常工作，承担局机关上传下达、督查督办工作；负责局机关政务信息、会务、文电、机要保密、档案、安全保卫、信访、机关后勤管理等工作。组织、协调相关股室（单位）办理人大代表建议和政协委员提案。拟定和组织实施环保信息化规划、计划；负责局机关电子政务平台、电子信息安全和信息化管理工作。

2．自然生态保护股（审批股）负责编制全县环境保护计划、规划，组织实施国家、省、市生态保护和农村环境保护政策、规划、法律、行政法规、部门规章和标准。组织、指导、协调、监督生态保护和农村环境保护工作，编制全县生态保护和农村环境保护规划，开展生态乡镇、村和生态示范建设，开展生态状况评估。组织编制全县环境功能区划，就环保方面参与制定本县国民经济和社会发展计划、国土规划、城市规划、区域开发规划及可持续发展纲要；负责全县开发项目、建设项目、治理项目立项的环保审批，审核环境评价、环境工程设计施工资格；监督管理县城环境和县内企业污染防治，负责县城环境综合整治定量考核，负责“三废”综合利用等有关工作；负责环保先进单位考评和清洁文明单位环保验收。监督管理农村生态环境，监督指导农村区域环境综合整治；监控重大资源开发活动可能引起的生态破坏；负责编制生态保护规划，指导并协调全县自然生态保护工作，会同有关部门开展生物技术环境安全监督管理工作和提出建立自然保护区的审批意见；组织拟定和监督实施本县重点流域、重点区域、重点行业污染防治规划；指导和监督矿区复垦、生态恢复、湿地环境保护工作；组织开展生物多样性保护、生物物种资源和生物安全管理以及自然保护区、风景名胜区、森林公园的环保工作；协调和监督野生动植物保护、湿地环境保护、荒漠化防治和珍惜濒危物种进出口管理工作。负责县级自然保护区的评审组织工作；监督全县有毒有害化学物品及放射废物的存放和处置。

3．法制宣教股（信息中心）负责拟订环境保护方面的地方性办法草案；承担局机关规范性文件的合法性审批工作；负责全局普法、行政复议、行政赔偿、应诉行政强制申请等工作；组织开展全县环境保护执法检查活动；指导和监督全县环境保护依法行政工作。负责组织、指导和协调全县环境保护宣传教育、绿色创建工作。拟定并组织实施环境保护宣传教育纲要；负责组织环境保护新闻发布，协调重要环境新闻的采访报道。归口管理社会公众参与方面的环保业务培训，推动社会公众和社会组织参与环境保护，承担环境保护社会表彰工作。协调、审核环境保护专项规划；承担局机关、直属单位的财务、国有资产管理、内部审计工作。负责项目申报及各级政府补助的环保专项资金的管理工作，承担建设项目“三同时”保证金的收取与退还。负责本县环保监察、监测能力建设汇总工作。制定环保财务计划，负责排污费财务管理和排污收费预、结算工作，审核环保科技基金、监测基金、环保贷款、环保示范工程等专项基金的投资计划，管理全县环保基建投资。

4．污染防治总量控制股 承担落实全县减排目标的责任。组织测算并确定全县重点区域、流域的环境容量。组织编制总量控制计划。提出实施总量控制的污染物名称、总量控制的数量及对全县各乡镇和重点企业的控制指标。监督管理纳入国家总量控制的主要污染物减排工作。负责污染减排工程运行监督工作。建立和组织实施总量减排责任制考核制度。负责审核涉及增加主要污染物排放总量新上项目的总量指标。负责核准节能减排财政和价格补贴。负责组织开展排污权交易、环境统计和污染源普查。编制并发布环境统计年报和统计公告。