山东清源集团有限公司机构设置：

设置财务部、综合部、经贸部、投资部、社团工委五大部门。

山东清源沥青科技有限公司机构设置：

设置综合管理部、生产技术部、安全环保部、经营管理部四个管理部门。

设置炼制车间、成型车间、催化车间、油品车间、维修车间、质检中心、保管中心、供应中心、销售客服中心、备件中心、研发中心十一个执行层单位。

山东清田塑工有限公司机构设置：

设置综合管理部、生产一部、生产二部、技术调度室、销售部、售后服务部、质保部、母料厂、供应部、保管科十个部门。

山东正本物流实业有限公司机构设置：

设置综合管理部、信息部、项目部、财务部、保管科、地磅室、电修部、采购部、业务室、安环部等十个部门。

山东清源国际贸易有限公司机构设置：

设置信息部、综合管理部、财务部、油品部、塑料部、销售部、办公室。

山东方宇润滑油有限公司机构设置：

设置综合管理部、信息部、项目部、财务部、销售部、技术研发部、工程部、生产部、保管科等九个部室。