办公室
主要负责收发、联络、信息、信访、保密、保卫、文秘、协调等工作以及后勤管理等。
组织人事科
主要负责组、检、宣、劳动人事、职改工作有关文稿拟草，引进人才交流，人事调配，劳动工资调整、审核。
计划财务科
主要负责编制与督促系统内的财务预、决算，掌握、了解经济运行状况，做好财务收支审计和效益审计。
海塘建设管理科
主要负责海塘工程的建设和管理，滩涂资源开发及管理，水政、水资源管理，维护水事秩序。
农村水利管理科
主要负责编制农田水利建设规划，制定和实施年度计划，编制年度排灌工程计划，并组织实施。
给排水管理科
主要负责农村自来水网改造的调研，编制年度工作计划，分析城镇排水设施运行状况，提出设备改造和维修养护计划，督查基层单位的给水排水工作。
