根据上述职责，文山州工业和信息化委员会设20个内设机构和老干部管理科。
(一)办公室。负责处理机关日常政务和事务，做好机关内外的综合协调，保证机关正常有序运转；负责机关规章制度的建立、完善和督促落实；负责机关文电、机要、档案、会务、接待、督察督办、政务信息等工作；负责扶贫工作；负责机关办公设备配备、车辆管理；负责机关财务、资产管理。
(二)政治处。贯彻落实党的路线、方针、政策，执行上级党委和委党委决议、决定，抓好非公企业的党建工作；负责纪委工作，并指导好委党委所属企业党组织开展纪检工作；负责抓好思想政治建设、组织建设、宣传工作和群团工作；负责组织推荐评选先进人物和优秀企业家工作；负责机关和事业单位的机构编制、人事、工资工作；负责机关和事业单位职工教育和培训工作；拟定全州工业、信息化人才队伍建设规划，指导工业、信息化人才队伍建设及干部培训。
(三)政策法规科。研究新型工业的战略性问题，组织研究工业和信息化发展的对策措施，提出政策建议；组织起草工业和信息化地方性法规、规章草案及综合性政策文件；组织制定工业、信息化发展产业政策实施办法；提出优化产业结构、工业与相关产业融合发展的政策建议，制定有关行业准入条件；负责机关普法工作，承担相关行政复议、行政应诉工作。
(四)发展规划科。研究提出工业、信息化中长发展规划和投资政策建议；拟订工业投资及工业重大建设项目规划，促进工业结构优化调整和产业升级，推动新兴产业发展；按照规定权限负责工业和信息化固定资产投资项目的审批、核准和备案，承担有关项目投资管理工作；负责企业的上市培育、融资工作；推进工业体制改革和管理创新；承担工业和信息化对外合作与交流的有关事务。
(五)经济运行科。监测、分析工业、信息化运行态势，分析行业形势并发布有关信息；拟订行业经济运行调控方案，提出政策建议并组织实施；协调解决行业运行发展中的有关问题，综合平衡调配生产和运行要素；协调推进银企合作，指导企业扭亏增盈和市场开拓工作；建立和完善工业预警机制，承担行业应急管理、产业安全和国防动员有关工作；负责协调铁路重点物资运输和紧急客货运输；监测分析工业物流企业运输态势，拟定工业物流企业发展有关政策措施并组织实施，指导和推进工业物流企业发展。
(六)技术创新科。指导企业技术改造、技术创新和产品质量管理工作，编制企业技术改造和技术创新规划和新产品开发计划；拟订政策措施并组织实施，组织协调关键共性技术攻关和重大技术引进、消化、吸收；推进高新技术产业发展，促进先进适用技术的推广和应用，推动产业升级、工业化和信息化融合；负责企业技术创新体系建设，指导和评价企业技术中心，负责有关新产品、新技术鉴定的工作；指导企业质量管理工作；推动企业技术创新和产学研相结合；培育工业品牌，实施企业知识产权战略。
(七)重工业科。承担州黄金管理办公室职责，负责有色、黑色、黄金、稀土、石化、农药等工业行业管理；负责通用机械、专用设备、电子信息设备及产品、汽车等行业管理；承担相关行业发展监测分析，研究市场动向，协调行业发展中的重大问题，促进工业结构调整优化，提出行业发展报告和建议，编制专项发展规划，拟订工业经济技术政策和技术标准；提出重大技术装备发展和自主创新规划的政策建议并组织实施；依托国家和省重点工程建设协调有关重大专项的实施，推进重大技术装备国产化；承担装备工业发展监测分析，编制专项发展规划，研究产业政策，提出行业发展报告和建议；承担农业化学物资行政保护有关工作。
(八)轻工业科。实施三七、轻纺、燃料乙醇、食品、医药、造纸、制糖、饲料、生物制药、包装等轻工业行业管理；承担行业发展监测分析，研究拟定行业发展规划、专项发展规划、行业规范技术标准和有关政策措施并组织实施，推进行业科技攻关和成果运用推广，组织实施行业重大专项工作，承担中药材生产扶持项目管理和国家药品储备管理工作。
(九)节约能源科。承担州节能办公室职责，参与拟订能源节约规划，拟订工业、信息化的能源节约政策和年度节能计划；负责工业和信息化节能工作并组织协调有关工作，提出行业专项节能项目和资金计划的安排意见；负责行业固定资产投资项目节能评估和审查，组织实施行业重大节能示范工程及新产品、新技术、新设备推广应用；承担行业节能效标识管理工作；拟订行业主要产品能耗限额和考核标准，负责行业节能监察工作，组织开展节能宣传、培训。
(十)资源综合利用科。参与拟订资源综合利用、清洁生产发展促进规划，拟订工业、信息化与环境、资源协调发展的政策措施，拟订工业、信息化资源综合利用、清洁生产和循环经济促进政策并组织实施；负责资源综合利用企业认定及监督指导工作；组织协调行业资源综合利用的重大示范工程和新技术、新产品、新设备、新材料的推广应用。
(十一)电力科（文山州电力行政执法局）。负责电力运行监测、预测和协调工作，提出电力运行的政策措施建议；拟订并组织实施电力运行应急方案，监管电网调度，协调解决电力运行中的有关问题，保障电力运行安全；负责电力行政执法工作；组织实施电力调度，承担电力需求预测管理工作；推进电力工业结构调整，组织实施大用户直供和矿电结合。
(十二)中小企业科。指导中小企业、非公有制经济发展，监测分析运行发展态势，协调解决有关重大问题，会同有关部门拟订促进中小企业、非 公有制经济发展的有关政策和措施；负责提出中小企业和非公有制经济社会服务体系、信用体系建设的政策措施并推动体系建设；指导中小企业和非公有制经济创业培训、公共信息、融资担保、技术创新、维权保护的平台建设；促进中小企业专业化生产和对外交流合作，指导中小企业结构优化和产业升级；协调处理非公有制经济经营者投诉，维护中小企业、非公有制经济经营者合法权益；推进中小企业法律服务体系建设；组织、协调、监督、检查企业治乱减负工作；负责民用爆炸物品行业管理；拟定汽车更新政策和行业规划，负责报废汽车回收监督管理；负责文山州加快发展非公有制经济工作领导小组办公室的日常工作。
(十三)建材科。承担州墙材办职责，研究拟定建材工业发展战略、产业规划；推进建材行业结构调整，拟定并组织实施全州建材产业政策；组织实施建材行业规章、规范和技术标准，推进建材行业科技进步；参与建材行业新建、改建、扩建项目的审查工作；负责新型墙体材料改革的管理职能，执行发展新型墙材、散装水泥的法规、规章和政策。
(十四)煤化工管理科。负责提出煤化工发展政策措施建议；拟定全州煤化工发展规划及政策措施；负责煤炭资源整合和煤矿矿井整顿关闭，组织指导煤化生产、技术改造，负责煤矿技改项目核准；负责煤炭许可证颁发；负责煤化项目前期、项目上报审批协调工作；负责煤炭项目工程质量认证；指导煤化工行业技术创新和技术进步，推进煤化工技术创新体系建设；负责煤化行业统计、分析和信息发布，指导煤矿质量标准化建设工作。
(十五)工业园区科。组织制定工业园区发展规划及政策措施，促进工业园区建设和科学布局；实施重点工业园区管理，促进产业聚集、企业集群发展；指导工业园区软环境建设和招商引资工作；承担工业园区发展监测分析，提出发展报告和建议，协调解决园区发展中的重大问题。
(十六)盐务管理科。承担州盐务管理局职责，负责盐业行政管理；拟定盐资源开发、盐业发展规划和年度调销计划并组织实施；负责盐业行政执法工作、指导和督查各县管理工作；负责盐业统计分析和储备盐管理工作；负责盐产品碘剂、添加剂、标志和包装物的监督管理；承担盐业有关行政复议和行政应诉工作。
(十七)无线电管理科。负责无线电行政管理，负责拟定全州无线电发展规划、频率指配与管理；受理设置无线电台（站、网）的申请，审核无线电台（站、网）的组网方案、建设布局和台址；按照权限审批无线电台的设置、使用，核发无线电台执照；负责无线电频率台站数据库和资料档案管理，征收无线电频率资源费；负责协调与军队和相邻地州市的无线电管理事宜及无线电管理的涉外工作；负责无线电专项资金的管理使用，做好中央转移支付资金的预、决算，财务支出，经费报销工作；负责无线电管理办公室国有资产的管理；协调处理无线电干扰事宜，指导全州各设台单位和个人的无线电通信保密工作；指导县级无线电管理机构和有关单位的无线电管理工作。
(十八)无线电监测监督科。承担州无线电监测站职责，监测无线电台（站）是否按照规定的程序和核定的项目工作；受理无线电干扰投诉，协调处理无线电干扰事宜；查找无线电干扰源和未经批准使用的无线电台（站）；测定无线电设备的主要技术指标；检测无线电发射设备；电磁环境测试和电磁兼容分析，无线电工程验收；检测工业、科学、医疗等非无线电设备的无线电波辐射；贯彻执行国家和省有关无线电通信业的法律法规，结合我州实际拟定地方性法规，并实施行政规章和行政执法监督；承办行政复议和应诉工作；依法组织实施无线电管制；负责无线电管理法规的宣传、贯彻，对销售市场、设台单位进行执法监督检查；负责无线电电磁环境综合治理和协调保护；配合开展无线电安保和维稳；承办省无线电监测中心交办的其它任务。
(十九)信息产业科。指导推进信息化工作，编制信息化产业发展规划并组织实施；协调信息化建设中的重大问题，协助推进重大信息化工程；指导协调社会信息化发展；协调跨行业、跨部门的互联互通和重要信息资源的开发利用；推进信息技术推广应用，促进信息化与工业化的融合；指导和推进软件、系统集成及信息服务业的发展；协调信息、安全保障体系建设；协调推进信息安全等级保护等基础性工作；拟订信息安全检查办法并组织实施，指导监督相关部门、重点行业的重要信息系统与信息网络的安全保障工作；承担信息安全应急协调工作，协调处理网络与信息安全重大事件；负责委机关网络信息建设和管理。
(二十)维稳安全科。负责贯彻落实上级关于维护稳定工作的要求和决定；加强调查研究、定期对非公企业影响稳定的情况进行分析预测，提出对策建议；对企业改制后的不稳定因素组织排查，及时发现和掌握影响稳定的重点问题，积极协调配合有关部门依法妥善处置群体上访事件，采取措施处置化解矛盾；负责信访和落实政策工作；负责机关社会治安综合治理工作；指导行业加强安全生产管理、安全生产信息管理和宣传教育工作。
老干部管理科。负责机关和所属单位离退休人员工作。
四、其他事项
(一)对外开展工作时，可使用文山州盐务管理局的名义和印章。
(二)原文山州经济委员会所属的乡镇企业产品质量监督检测中心划给文山州农业局管理。
(三)原文山州无线电管理处离退休人员划归文山州工业和信息化委员会管理。
(四)文山州交通局牵头，会同文山州发展和改革委员会、文山州工业和信息化委员会等部门建立综合运输体系协调配合机制。文山州工业和信息化委员会配合协调综合运输计划的实施。
(五)文山州发展和改革委员会负责拟订煤炭发展战略、行业规划。文山州工业和信息化委员会负责指导煤炭生产、技术改造。文山州安全生产监督管理局负责煤矿安全生产监督管理。
(六)文山州发展和改革委员会负责编制和组织实施现代物流发展规划、战略、政策。文山州工业和信息化委员会负责指导和推进工业物流企业发展。文山州商务局负责指导和推进商业物流企业发展。
(七)其他所属事业单位的设置、职责和编制事项另行规定。
