用染色体荧光原位杂交技术，以18-26srDNA为探针对部分野生菊属植物和三个栽培类型共11个分类单位进行了检测。rDNA信号特号特异地定位于核仁组织区NOR端，根据它的数目及分布，推测菊花脑、野菊、甘野菊之间的亲缘关系较近，毛华菊其次，紫花野菊与上述四种的关系较远；载培菊的rDNA数目与毛华菊的相似，但呈现一定的波动性，暗示栽培菊与形态无明显相关性；基因组DNA为探针时没能检到特异性信号，可能与该属复杂的种质渗入现象有关；对12个分类单位的AFLP实验结果也发现多数野生种特有或特异缺失的条带较少，证明菊属植物间存在频繁的基因交流。研究中还报道了毛华菊的花朵形态变异。
