1998年，《普通高等学校本科专业目录新旧专业对照表》中机械设计制造及其自动化（080301）由机械制造工艺与设备（080301）、机械设计及制造（部分）（080306）、汽车与拖拉机（080309）、机车车辆工程（080310）、流体传动及控制（部分）（080312）、真空技术及设备（080314）、机械电子工程（080315）设备工程与管理（080317）和林业与木工机械（081502）合并而来 。

2012年，《普通高等学校本科专业目录新旧专业对照表》中机械设计制造及其自动化（080202）由原机械设计制造及其自动化（080301）、制造自动化与测控技术（080309S）、制造工程（080311S）、体育装备工程（080312S）和交通建设与装备（部分）（081210S）合并而来 。

2020年2月，在教育部发布的《普通高等学校本科专业目录（2020年版）》中，机械设计制造及其自动化专业隶属于工学、机械类（0802），专业代码：080202 。