根据上述职责，区审计局设5个职能科室和区经济责任审计办公室。

（一）办公室。

组织协调局机关日常工作;负责机关文秘、档案、安全、信访、督查、财务、会务、后勤管理服务、政府信息公开和区12345市民服务热线办公室转办事项的办理等工作;负责机关和所属单位组织人事、机构编制、教育培训等工作；负责机关离退休人员的管理服务工作；负责相关人大代表建议、政协委员提案的办理工作和综合文稿的起草工作；指导和监督内部审计工作。

（二）政策法规科。

起草全区审计规范性文件;审理复核有关审计业务事项;承担局机关规范性文件的合法性审核工作;办理审计移送和申请法院强制执行事项;负责行政复议和行政应诉相关工作;组织审计听证事项;组织开展审计普法教育；依法检查审计决定执行情况，督促纠正和处理审计发现的问题；核查社会审计机构对依法属于审计监督对象的单位出具的相关审计报告；调度各科室督促被审计单位整改落实。拟订审计信息化管理制度、计算机审计规范和技术标准并组织实施；组织研究开发与推广应用审计软件和管理软件；为局机关各科室提供计算机技术服务，开展计算机审计和辅助审计业务；负责业务统计工作。

（三）财政审计科。

拟订区级预算执行情况的审计总体方案,汇总审计结果;负责审计区级预算执行情况、其他财政收支情况、区地方税务系统税收征管情况、区国库办理区预算资金的收纳拨付情况、下级人民政府预算执行情况和决算;负责审计区财政、区地方税务等部门及其下属单位的财政财务收支;开展专项审计和审计调查;指导全区财政审计业务。

（四）经贸社保审计科。

负责全区行政机关（事业单位）财政、财务收支审计工作和区属国有企业和区政府规定的区属国有资本占控股或主导地位企业的资产、负债和损益审计；开展专项审计和审计调查;负责全区社会保障审计工作。指导全区行政事业审计、社会保障审计业务。

（五）投资审计科。

负责对区政府投资项目概（预）算执行情况和决算以及区政府投资项目有关建设、勘探、设计施工监理、采购、供货等单位财务收支的审计监督；负责对政府投资项目的概算、工程结算、竣工决算的审查和监督，以及监督政府投资项目工程招投标；负责对国有资产移交、组织与固定资产投资项目进行专项审计或审计调查，以及对委托审计项目的招投标和对委托审计项目进行管理等交办的其他审计事项。指导全区固定资产投资审计业务。

区经济责任审计办公室（副处级）

根据区委、区政府的安排负责对区直党政机关、事业单位、群众团体、镇街党政正职领导干部（含主持工作的副职）及区属国有企业、国有控股企业法定代表人进行经济责任审计和自然资源资产离任审计；负责经济责任审计工作的组织、管理和协调；组织对重大经济责任审计项目统一进行审计。承担区经济责任审计工作领导小组办公室的具体工作。