（一）办公室

协助局领导组织协调机关日常工作，负责机关文秘、宣传、信息、档案、机要、保密、信访、督查、会议的组织安排和综合性文稿的起草及规章制度建设，组织调查研究，掌握全市水利工作动态。

（二）人事科

负责局机关并指导局直属单位的人事、劳动工资、劳动保障、劳动保护、干部职工教育培训工作；负责精神文明建设及党群工作；承办局管干部的管理工作；指导水利行业职工队伍建设；承办局党委日常工作。

（三）计划财务科

组织拟定全市水利发展战略、中长期规划和年度计划，会同有关部门拟定水长期供求计划，负责组织全市重要水利基建项目建议书和可行性研究报告的编制、审查和立项申报工作；组织编制流域综合规划和专项规划，协调流域开发工作；拟定全市水利行业的经济调节措施；对水利资金的使用进行宏观调节；研究提出有关水利的价格、税收、信贷、财务等经济调节意见；管理国家、省、市技水利经费的使用；对全市水利系统国有资产进行监督管理，指导局直属单位的财务工作，负责局机关的时务管理和行业内市工作；承办全市水利综合统计分析工作。

（四）水政科（挂下水政监察支队牌子）

拟定全市水利法制建设规划；研究提出有关水利方面的方针政策，组织拟定有关规范性又件和改革方案；实施指导水政监察和水行政执法工作，承办县（区）和部门间水事纠纷协调处理的有关工作；承办局行政应诉、复议和普法教育工作。

（五）离退休干部科

负责局机关离退休人员的管理服务工作；指导局属单位离退休人员服务工作。