（一）办公室。负责局机关日常运转工作，负责文秘、机要、档案、局机关内部规章制度建设等。承担局机关和局属单位的干部人事、机构编制、教育培训职称改革、出国（境）管理等工作，负责局机关离退休人员工作。承担绩效考评、政务信息、保密、信访、政务公开、新闻宣传等工作。

（二）财务股。负责部门预算管理工作，承担局机关财务管理、会计核算和国有资产管理以及代管局属有关单位财务管理和会计核算工作。承担局属单位财务、资产、绩效、政府采购、国库集中支付、非税收入等指导和监督工作。提出有关水利价格、税费、基金、信贷等政策建议。

（三）规划计划股。拟订全县水利发展规划，组织编制水利综合、专业、专项等重大规划。组织重大水利建设项目前期工作设计文件审查。组织指导有关防洪论证、水利工程建设项目合规性审查、跨区域跨流域水资源供需形势分析、大型调水工程前期工作。组织提出中央和自治区水利建设投资计划安排建议，统筹协调项目实施的监督管理和绩效管理。承担水利统计工作。

（四）水政股。负责水利法制工作；草拟水利规范性文件；负责组织江河岸线的审定及河道管理范围内建设项目的审批工作；负责组织指导水政监察和水行政执法工作；负责协调、处理乡镇间的水事纠纷；承办水利行政诉讼、行政复议和水法规宣传教育工作。组织协调局依法行政工作，提出综合性水利政策研究建议。承办局行政规范性文件立项、合法性审查、备案和清理工作。承办局行政应诉、行政复议和行政赔偿工作。

（五）水利技术股。负责草拟水利科学技术发展规划；负责重要水利科学研究、水利科技成果鉴定、管理及科技推广工作；负责监督实施水利行业技术标准和规程规范；负责水利工程突发事件技术处理。承担有关水利项目技术审查、审批工作。

机关党组织。负责机关和所属单位的党群工作。