根据上述职责,市水利局设7个内设机构:

(一)办公室。

协助局领导对各科室工作进行综合协调、组织机关日常工作;负责督促检查各科室和直属单位对重要工作的执行落实情况;负责重大会议的组织;负责政策调研、政务信息、文秘综合、档案、信访、接待、保密、保卫、机关内部规章制度建设等工作;负责公共机构节能工作。

(二)行政审批办公室。

根据国家有关水行政和渔业管理工作的方针、政策和法律、法规,负责水行政和渔业管理方面有关行政审批事项的受理和审批工作;负责组织协调行政审批事项的勘查、论证、审核等相关工作;负责有关行政许可证的发放工作;负责行政审批专用章的使用管理;负责行政审批事项的行政复议和行政应诉;负责法律、法规、规章规定应由水利行政部门承担的其他行政审批事项。

(三)人事科。

负责局机关和直属单位的人事、工资福利、机构编制、体制改革、档案等管理工作;负责教育培训和人才队伍建设;负责局机关离退休人员管理服务工作;指导直属单位的离退休人员管理工作。

(四)规划计划科。

拟订市本级水利战略规划,组织编制重大水利综合规划、专业规划和专项规划;审核市本级水利项目建议书、可行性研究报告和初步设计;负责提出年度投资计划建议,负责市本级水利投资计划的编制和管理;承担市本级水利统计工作。

(五)农田水利科。

组织协调全市农田水利基本建设;指导农村饮水安全、节水灌溉、灌(涝)区、水田等工程建设与管理工作;指导牧区水利规划;指导农村水利社会化服务体系建设。

(六)工程建设管理科(安全监督管理科)。

指导全市水利(渔业)工程建设管理工作;监督市重点工程及江河堤防、城市防洪、水库等防洪工程(不含应急度汛、地方水电项目)的建设管理;负责水库日常运行的监督管理;负责市直水利工程建设招标投标管理;指导全市水利工程建设的质量监督;指导市直水利经济管理工作;负责市管水利工程建设的质量监督工作;监督管理市管水利建设市场;负责市管水利勘查设计、施工、监理、工程质量检测单位和招标代理机构的行业监督管理;指导全市水利工程建设项目及运行管理的执法监督。负责市直水利(渔业)行业安全生产工作;负责市直水利工程施工现场安全监督检查工作;负责调查处理并协调解决较大水利安全事故;履行法规规定的行政许可职责中涉及安全的有关事项;承担安全生产相关情况的报送工作。

(七)水产科。

拟订全市渔业发展规划、计划并组织实施;指导渔业标准化生产和健康养殖;负责渔业水域生态环境和水生野生动植物保护;组织水产品质量安全的监督管理;指导水生动植物的防疫检疫、病害防控、水产病情测报、水产技术推广及示范工作;组织、指导渔业基础设施建设与管理;协调处理一般渔事纠纷;承担水产综合统计,发布水产信息。

党委办公室。负责机关及直属单位的党群、纪检监察工作。