根据上述主要职责，市价格监督检查局内设7个职能科室：

（一）办公室

协调机关日常政务；制定机关工作制度并组织实施；承办会议组织、文电处理、政务信息、文书档案、信访及人事、劳资等项工作；负责全市价格监督检查基层工作指导和队伍建设工作；承担全市价格监督检查统计工作；负责起草全市价格监督检查工作计划、总结及有关会议文件；组织全市价格监督检查干部培训工作。

（二）公共产品价格检查科

负责指导、协调全市公共产品（水、电、煤气、电信等）价格的监督检查工作，组织实施价格检查；直接查处县（市）区政府、市直各部门、中省直及其他有关企业的价格违法行为和案件；组织协助各县（市）区查处工业品价格方面的重大违法案件。

（三）涉农价格收费检查科（价格认证中心）

负责指导、协调全市涉农价格和收费的监督检查工作，组织实施价格和收费检查；直接查处县（市）区政府、市直各部门及中省直企事业单位的价格和收费违法行为和案件；组织协助各县（市）区查处涉农价格和收费方面的重大违法案件。

负责涉案的物品价格认证工作。指导县（市）区价格认证工作。负责对县（市）区有争议的涉案物品价格评估结论进行复议仲裁。

（四）行政事业收费检查科

负责指导、协调全市行政事业性收费的监督检查工作，组织实施全市行政事业性收费检查；直接查处县（市）区政府、市直各部门及中省直企事业单位的收费违法行为和案件；组织协助各县（市）区查处行政事业收费方面的重大违法案件。

（五）经营性收费检查科

负责指导、协调全市服务类价格和收费的监督检查工作，组织实施服务类价格和收费检查；直接查处县（市）区政府、市直各部门及中省直企业的服务类收费违法行为和案件；组织协助各县（市）区查处服务类价格和收费方面的重大违法案件。

（六）监督指导科

指导全市价格监督检查工作的案件审理和价格监督检查行政应诉工作；受市发改委的委托，受理、承办价格行政执法案件的行政复议；负责全市价格行政执法督查工作；指导全市群众性价格监督组织和行业价格监督组织工作及企业内部价格监督工作。

（七）价格举报受理科（价格举报受理中心）

指导全市价格举报受理工作；受理价格违法乱纪行为的举报以及上级机关交办和其他部门转办的价格举报事项；对受理的举报件提出拟办意见；按照规定承办价格举报的调配或处理；负责价格举报案件的督办。