闽清县交通局的主要职责是：

(一)贯彻国家有关交通行业的发展战略、方针、政策和法规，并监督执行;

(二)根据全县的总体布局，组织编制全县公路和水路交通事业发展规划及中长期计划和年度计划，并监督实施。组织、指导开展县交通基础建设项目的前期工作和后期评价工作。

(三)行使全县交通基础设施建设行业职能，负责全县公路、水路交通建设工程招投标管理和工程质量管理。负责公路、水路交通战备工程的组织实施，组织交通工程建设的实施。行使全县公路、运输场站、港口、航道及其设施建设、养护、管理等行业的行业管理职能。

(四)负责全县公路路政管理工作，行使公路路政的行政管理职能，依法制定公路路政管理规章制度。指导公路路产的管理工作。

(五)培育和管理交通运输市场。行使道路、水路客货运输(含城市出租车客运)、搬运装卸、汽车船舶维修(含汽车综合性能检测站)、运输服务业(含公路客运站及售票点、营业点、营运车辆停发车场)的行业管理职能。承担县交通战备领导小组办公室日常工作。

(六)行使汽车驾驶学校和驾驶员培训工作的行业管理职能，贯彻国家有关技术标准、教学大纲，负责制定管理规章和总体布局规划并实施监督检查。

(七)指导交通行业的体制改革和企业管理工作。组织各项交通规费的征收、管理、使用和监督。

(八)负责交通行业安全生产监督管理;负责内河水上安全监督、内河船舶(不含渔业捕捞船舶)及水上设施检验和防止船舶污染、航行保障、救助打捞、通信导航;行使交通通信行业管理职能。

(九)组织编制科技发展项目中长期规划和年度计划;负责交通行业的技术和质量监督。指导交通行业职业技术教育以及成人教育;指导效能行业各种工人职业技能培训、鉴定工作。

(十)承办县委、县政府交办的其他事项。