建苗圃
苗圃地宜选择交通方便、地势平坦、水源便利、排水良好、土层厚度在45厘米以上的地块，土壤为壤土、砂壤土、无盐碱。苗圃地不宜重茬。播种前每公顷撒施有机肥3.75千克左右。深翻细耙，平整做畦。畦面宽1.2-1.5米、畦长和埂高以利于灌溉为宜。
种子采收与选种
选择生长健壮母株上充分成熟的果穗，采下果实，用水漂去虫果（通常为红色）、不饱满果。捞出下沉绿色果，及时将采收果实放入35-45℃的草木灰温水中浸泡2-3天，搓烂果肉，除去蜡质，用清水将种子冲洗，阴干后贮藏。并进行种子质量检验，种子含水量不高于10%，净度不低于85%，发芽率不低于35%。
种子贮藏
分干藏和湿藏两种，干藏适合大量贮藏种子，湿藏适宜少量贮藏种子或催芽。
干藏：将果实采收后晾干，装入透气良好的袋子内，在低温、干燥条件下贮藏备用。
湿藏：将阴干的种子按种沙1:3比例混合后放入层积坑内或堆积于背风向阳地面，用草席或塑料布覆盖，防止失水。在层积坑内垂直预埋几束秸秆，用于通气。河沙湿度以手握成团不滴水为宜。覆沙成馒头状，来年春季种子有1/3露白时即可播种。
播种前种子处理
秋冬播种子可随采随播，不进行催芽处理，也可以经选种后，清水浸泡2天搓去果肉并进行驱避剂等药剂处理，以防鸟兽危害。春播种子需进行种子处理，处理方法有两种：经过冬季沙藏的种子春播前处理：经过冬季沙藏的种子可直接播种，也可再经过催芽待1/3露白时播种。没有经过冬季沙藏的种子春播前处理：在播种前，将干藏的果实用清水、35-45℃的草木灰温水、5%的石灰水均可浸泡2-3天，洗去果肉，然后在太阳下暴晒种子2-5小时，70%以上的种子开裂后即可播种。
播种时期
分秋冬播和春播。秋冬播掌握在土壤上冻前进行，播后浇封冻水。春播应在3月上旬至4月中旬进行。
播种量
根据黄连木种子平均每千克约11000粒的特点，提出合理播种量为每公顷75-120千克，预期每公顷培育成苗30-45万株。纯度低、发芽率低的种子适当增加播种量。
播种方法
采用开沟条播，行距20-30厘米，株距5-10厘米，播种深度1-2厘米，人工撒播或机械播种，播后覆土。冬播种子应在翌年春季去除较厚表土约1厘米，根据土壤墒情浇水1-2次，无灌溉条件应于早春覆地膜保湿。春播种子，宜乘墒覆地膜（兼防鸟害）、草、松针均可。如播后墒情不好，先浇水后覆膜。
当出苗量达到45%以上后，可看气温逐步揭膜或揭去覆草。连续晴天高温可将覆膜不定距划破放风，防烧苗。大部分出苗后，逐渐将覆膜全部划破，当苗充分锻炼，出苗整齐后将覆膜或覆草揭去。
当年播种苗及时间苗，苗长到5厘米左右时，拨除生长过于密集、发育不健全和受伤、感染病虫害的幼苗。在间苗的同时，对幼苗过于稀疏地方要进行补栽。苗高7-10厘米时，即可定苗。每公顷留苗量22-30万株为宜。
苗高达15厘米以上时，每公顷施75-120千克尿素，施肥后立即浇水。幼苗期施肥以氮肥、磷肥为主，速生期适当多施氮肥，配施磷、钾肥，苗木硬化期以钾肥为主，8月下旬停止施氮肥，生长期施氮肥2-3次。搞好排灌设施，采用不同的灌溉方法，使水分均匀地分配在苗木根系活动的土层中。根据天气干旱情况，适时、适量灌溉，发现积水，立即排除。
按育苗常规进行中耕保墒、松土除草，除草做到除早、除小、除了，达到圃内无杂草。松土结合除草进行外，一般在降雨或灌溉后也要松土，防止土壤板结要逐步加深，全面松到，不伤苗，不压苗。
