控制器有不同的策略来找到模组的最大功率输出。最大功率点追踪控制器可能有不同的算法，并且视运作条件选择适当的算法。

最大功率点追踪扰动观察法

扰动观察法（Perturb and observe）的控制器会小幅的增加或减少电压，并且量测其功率。若功率增加，继续依相同方向调整电压，一直到功率不增加为止。此方式称为扰动观察法（Perturb and observe），是最常见的最大功率点追踪方式，不过其输出可能会有小幅的功率震荡。此算法属于爬山算法，是依照功率对电压的曲线在未到最大功率时曲线会上升，超过最大功率时曲线会下降的特性而来的。扰动观察法因为容易实现，是最常使用的最大功率点追踪方式。若是配合了适当的估测及适应性爬山算法，扰动观察法可以达到最高的效率。

最大功率点追踪增量电导法

增量电导法（incremental conductance method）的控制器会渐进式的调整太阳能模组的电压及电流，以预测改变电压后的影响。此方式的控制器计算量较大，但追随条件变化的速度比扰动观察法要快。增量电导法和扰动观察法类似，可能会造成输出功率的震荡。此方法会利用太阳能模组的增量电导（incremental conductance, dI/dV)，来计算功率对应电压变化比例(dP/dV)的符号为正或为负。

增量电导法计算最大功率点的方式是比较增量电导（I_Δ/ V_Δ）和模组的电导（I / V）。若二者相同时（I / V = I_Δ/ V_Δ），其输出电压即为最大功率点电压。控制器会维持此电压，若照射条件改变时，会再重复上述的流程。

最大功率点追踪电流扫描法

电流扫描法（current sweep method）会针对太阳能模组配合一个扫描用的电流波形，可以每隔一段时间量测且更新电流-电压曲线的关系。再依最新的电流-电压曲线找到最大功率点，设法使系统运作在最大功率点。