土壤有机质是指土壤中含碳的有机化合物。主要包括动植物残体、微生物残体、排泄物和分泌物等部分。在植物残体中，包括各类植物的凋谢物，死亡的植物以及根系，这是自然状态下土壤有机物的主要来源。在微生物残体中，主要包括各种微生物的残体。这部分来源相对较少。但对原始土壤来说，微生物是土壤有机质的最早来源。菜园土和红色土壤的有机质的来源差不多相同，但是菜园土则是通过人们长期施用大量的可溶有机质，如人类粪尿、有机垃圾、土杂肥等。其较好的解决了养分能量供应的问题，人为的改造使菜园土的有机质含量很高，我们做实验所用的红壤是采自砍伐炼山后挖穴种植树木4年后的土壤，其位于南屿林场的中坡上，所以其土相对处于自然条件下，没有受到人为的干预，所以其有机质的含量明显低于菜园土的。

土壤有机质的转化过程一般分为化学转化过程，生物转化过程等两个部分。

①化学转化过程 主要包括生物学以及物理转化过程。生物学转化过程又分为腐殖化过程和矿质化过程。腐殖化过程和矿质化过程都发生在土壤之中，它们两者相辅相成共同推动土壤有机质的含量的富集，提高土壤有机质的含量。菜园土是人为改造的，其中矿质化过程和腐殖化过程明显高于同层红壤土层，所以，经过长时间的富集转化过程，菜园土的有机质含量高于红壤土。

②生物转化过程 这个转化过程主要包括土壤中的一些细小动物和微生物的日常活动对土壤有机物的含量的影响。由于菜园土人为管理因素很大，使得菜园土壤的孔隙大，通气状况良好，氧气含量高，这就使得一些好痒的微生物和动物的活动能力加强,分解能力土壤的能力加强，则土壤的有机质含量会升高，而红壤土是天然形成的，人为干预很少，比起菜园土，其土壤有机质的含量明显偏少。