该院环境工程专业于1993年设立，1995年开始招收本科学生，2000年获得硕士学位授予权，是广西较早设立的环境工程专业办学点和环境工程博士点建设单位。为广西，尤其是桂林的环境保护事业做出了重要贡献。当前已在典型岩溶地区水资源保护与利用，城市垃圾、废旧塑料处理与资源化利用，小流域水环境保护与污染处理，工业废水处理技术等研究领域形成了鲜明特色，尤其是对广西区的重要产业如味精、制糖，淀粉等行业中产生的高浓度有机废水处理技术等有其独到之处。
在长期的学科建设与发展中，环境科学与工程学院发扬地质、化探、水文、环境等多学科交叉的优势，在矿山环境修复、环境治理、水资源保护、水污染控制、固体废弃物处理与处置中取得了一批先进成果，曾获得包括国家科技进步特等奖、国家教学优秀奖等在内的各级奖励数十项，该院先后承担包括国家973项目、国家863项目、国家重大专项、国家科技攻关和国家自然科学基金项目在内的各类科研项目100余项。
