第四十四条 水专项组织实施过程中实行保密制度。水专项保密管理实行第一责任人制度，各相关单位和人员必须严格遵守《实施科技重大专项的保密规定》和《国家科技重大专项档案管理规定》的有关规定。

第四十五条 水专项建立科学、规范的档案管理制度，将水专项实施过程中产生的具有保存价值的电子文档、文字资料、声像资料、照片、图表、数据信息等档案进行及时收集、整理和归档。水专项档案管理的具体要求另行制定。

第四十六条 水专项建立规范、健全的科学数据和成果的共享机制。项目（课题）承担单位应按照水专项办有关科学数据共享和信息管理的规定，按时上报项目（课题）有关科研数据和成果。水专项办建立项目（课题）数据和成果库，实现信息公开、资源共享。

第四十七条 水专项办负责建立统一的信息管理平台，并与重大专项信息管理平台相衔接。信息内容主要包括水专项实施方案（公开版）、实施计划、项目（课题）立项、经费预算、监测评估、验收和成果等信息。相关单位或个人发布涉及水专项的重要信息，需要报水专项办批准。

第四十八条 结合水专项目标的实现，水专项办制订系统的引进消化吸收和提升自主创新能力方案和措施。项目（课题）承担单位开展有关重大国际合作活动，由水专项办批准，水专项牵头组织单位核准。

第四十九条 水专项实行科研人员信用管理制度，对参与和执行水专项的相关人员在立项、检查、评估和验收中的相关信用状况进行客观记录和评价，将信用评价结果作为水专项管理与决策的重要依据。

第五十条 水专项牵头组织单位对在水专项研究开发和管理工作中做出突出成绩的人员或单位给予表彰。

第五十一条 对于在申请、评议、评审、评估、检查、执行和验收过程中发现的弄虚作假、徇私舞弊行为，以及违规操作或因主观原因未能完成合同任务并造成重大损失者，水专项实行责任追究制度。情节较轻的公开通报直接责任者，终止相关项目（课题），清理账目与资产；情节较重的在一定时期内取消直接责任者承担水专项任务的资格；构成违法违纪的，建议相关部门对直接责任人依法给予处分。