在自然和日趋强烈人类活动的影响下，流域或区域尺度的水循环过程发生了深刻变化；与此同时，伴随着水循环过程的水环境与水生态过程也发生了显著变化。采用先进的水资源与水生态工程技术，对水资源与水生态过程的演变进行有效调控；充分发挥水资源经济社会效益及生态与环境效益，维系变化环境下供用水安全、水环境安全和水生态安全，促进人与自然的协调发展，是当前各个国家、流域和地方在发展中面临的重大战略及发展问题。然而，当前水资源和水生态相关工程技术的整体发展尚不能满足上述实践需求，人类仍然面临着较为严重的水危机风险；亟待研发和推广相关的水资源与水生态工程技术；我国尤为如此。在这种情况下，水利部高瞻远瞩，决定成立部级水资源与水生态工程技术研究中心，以促进我国水资源与水生态工程技术的整体发展及推广应用。在人才队伍、支撑条件和相关前期工作基础等方面进行综合比选的基础上，水利部决定依托于中国水利水电科学研究院、成立我国首个部级水资源与水生态工程技术研究中心。
