利用异重流特性，在水库减淤，给水排水工程设计与运用等方面可获得很大效益。在多沙河流上修建蓄水水库和水电站时，设置底孔，合理运用在库底运动的浑水异重流可把泥沙排走,减少水库淤积,是水库减淤的主要措施；在给水工程中，根据异重流特性设计沉淀池，有利泥沙落淤，可获得较好的水质；修建火电厂可利用温差异重流特性，设置较深的取水孔引取冷水，而设置较高的排水孔排放热水。
但在某些情况下，异重流可带来很大危害。在河口形成的盐水楔往往阻碍上游来沙的下泄，并把海域泥沙带入河口，形成含沙量高的滞流区和拦门沙；在与河道交叉的引水渠或引航道处，浑浊河水可潜入引水渠或引航道，并向渠首内溯，而渠内清水自表层向大河回流，造成严重淤积等。
