协会依法实施行业自律，严格按照国家法律、法规，规章开展活动。是本协会的登记主管部门，省国土资源部门是本行业的业务主管部门。

2004年9月，江苏省土地估价协会进行了换届选举，产生了第二届协会理事会，选举了会长、副会长、秘书长、副秘书长，其人员名单为：会长张洪甫；副会长宋玉波、李如海、楼中妙、曲福田、王海宏、濮励杰、黄克龙、张其宝；秘书长薛荣元；副秘书长徐红华、王黎明。

协会设秘书处，现聘有3名专职工作人员：薛荣元、徐长法、李培君。并有兼职工作人员数人。

2006年2月，经协会常务理事会审议通过，还成立了协会组织会籍委员会、教育考试委员会、技术审裁委员会和协会专家库

第二届协会成立后的经常性工作主要有：受理土地评估中介机构和土地估价师的执业注册及有关登记发证；对土地评估中介机构和土地估价师的执业情况进行年检考核和抽检，组织机构资信等级评定；实施土地估价师的继续教育，组织开展行业学术技术研讨、交流；受理有关信访举报，调处业内矛盾或纠纷；按中国土地估价师资格考试委员会的统一部署，组织承办本省的土地估价师资格考试即考前培训；开展调查研究，拟定并督促执行行业规范；承办行政主管部门交办的工作等。