江苏省质量安全工程研究院设立管理委员会（以下简称管委会）作为研究院的战略决策机构。管委会成员由江苏省质量技术监督局与南京财经大学共同提名，主要包括管委会主任2名、副主任2名、成员5名。管委会一年召开一次会议。
管委会人选
管委会主任：靳道强、姜建中
管委会副主任：张前、鞠兴荣
管委会成员：（江苏省质量技术监督局）祁宁清、卢保国、袁彪
（南京财经大学）王海燕、胡荣华
江苏省质量安全工程研究院设立研究院院务委员会为管理决策机构。院务委员会成员包括：名誉院长1名、院长2名、常务副院长1名、副院长4名等。
院务委员会成员
名誉院长：刘平均
院长：鞠兴荣、张前
常务副院长：王海燕
副院长：（江苏省质量技术监督局）祁宁清
（南京财经大学）胡荣华、胡秋辉、曹杰
科研秘书（江苏省质量技术监督局）：
科研秘书（南京财经大学）：郑继媛
基础理论部：围绕国家质量安全领域的重大需求，追踪国际质量安全研究的前沿，前瞻性地开展质量安全标准的技术经济理论、复杂系统质量安全风险评价与控制理论以及质量安全的法理基础等研究，进一步完善适合我国国情的质量安全基础理论体系。基础理论部已经在光谱图学、质量经济学、安全行为学、公共服务质量管理等前沿领域取得了一批原创性研究成果。
工程技术部：面向政府服务型行业、企业生产部门的质量安全领域，致力于质量安全评价的实测技术、灾害监测预警与控制、质量安全信息化技术等工程应用研究。关注质量安全共性、关键性、前瞻性技术，开发质量安全分析评价的新技术、新工艺、新装备，重点开展质量安全领域重大科技攻关和技术示范工作。工程技术部现有国家级粮油品质检测工程技术中心及省部共建质量系统工程实验室，现已开发的系统有:基于红外光谱的产品质量检测系统、重大交通工程质量安全监测系统。
评价中心：针对农业、工业及现代服务业的产品及服务的发展需求，在基础理论部的质量安全研究成果与成熟的质量安全工程技术平台基础上，围绕用户评价、品牌价值测度、质量安全可靠性分析技术等方面，从社会公益性的角度提供专业精准的第三方测评、研究及咨询服务。目前评价中心已在江苏省及长三角地区广泛开展了政府绩效评价、企业用户满意度测评、公共设施与环境安全评价等方面的工作。
国际交流中心：研究院瞄准质量安全专题，积极开展国内外质量安全领域的高端学术交流，聘请国内外知名专家、学者作为顾问，与国内外一流大学、研究机构共同开展节能减排、绿色加工检测等理论与技术的国际间合作研究项目。目前已与美国能源基金会、GE公司、加州大学戴维斯分校等国际一流研究机构建立了战略合作伙伴关系。
行政部：负责研究院日常事务的处理，主要包括：人力资源协调调度、财务管理、办公设施与设备管理、文档管理等。
