与麻省理工学院、普林斯顿大学、加州大学伯克利分校、北卡罗莱纳大学（教堂山分校）、亚琛工业大学等国际著名院校密切合作，与国际著名企业和组织联合开展工业工程应用研究，如：美国利宝互助集团、摩托罗拉公司、通用汽车公司、诺基亚公司、英特尔公司、卡特彼勒公司、三菱重工、荷兰CORDYS公司、P&G公司等。
聘请国内外知名学者为客座教授，参与本系的教学和科研工作，包括德国工程师学会主席 Hubertus Christ博士，美国德州大学PAN分校工业工程系前系主任、理工学院院长、现富士康集团科技总经理陈振国博士，前国际人类工效学联合会主席Ian Noy博士，美国工程院院士、香港城市大学校长郭位教授，美国工程院院士、佐治亚理工学院教授吴建福教授、美国工程院院士、麻省理工学院教授Crawley教授等。
美国人因与工效学学会中国分部的秘书处设在清华大学工业工程系。
