（一）办公室。负责机关日常运转，承担文秘、信息、安全、保密、督查、后勤、档案、政务公开、信息化、新闻宣传和重要文稿起草等工作。牵头办理人大建议、政协提案。

（二）组宣人事处（挂党建工作处牌子）。承担机关和直属单位干部人事管理、机构编制、内部审计等工作。负责牵头意识形态和宣传思想工作。承担离退休干部服务管理工作。牵头直属单位党的建设工作，指导系统队伍建设。

（三）法规处。组织拟订住房和城乡建设的有关政策，监督检查住房和城乡建设法律法规及政策执行情况。指导监督依法行政工作。负责有关文件合法性审核工作；承担行政应诉、行政赔偿相关工作，协助办理行政复议工作，组织普法宣传。负责牵头信访工作。

（四）政务服务管理处。承担“最多跑一次”改革相关工作，负责行政审批制度改革工作。牵头协调并按权限和分工承办政务服务（含行政许可、公共服务等）事项相关工作。负责入驻政务服务大厅窗口的日常管理工作。指导协调系统 “最多跑一次”改革和政务服务管理工作。负责牵头建设领域信用体系建设。

（五）计划财务处。拟订并组织实施住房和城乡建设发展规划、城市基础设施配套建设年度计划，承办住房和城乡建设资金管理工作。承担机关和直属单位财务、资产管理、国有资产监管等工作。牵头组织相关重点工程项目建设，并督促实施。

（六）住房管理处。拟订全市公共租赁房、廉租住房、经济适用房政策，组织编制并监督实施住房保障发展规划、年度计划。会同有关部门编制廉租住房、公共租赁房资金预算，承担公共租赁住房承租资格确认、相关租赁补贴和租金减免审批工作。牵头编制房地产业发展规划，组织拟订房地产市场相关政策，并指导、监督实施。指导监督房地产开发、房屋交易、房屋租赁、房屋面积、房地产估价与经纪、房屋装饰、物业管理、房屋使用安全、房屋白蚁防治等行业管理工作。牵头拟订并指导、监督实施国有土地上房屋征收与补偿政策。拟订并指导、监督实施全市城镇危险房屋治理改造相关政策；负责城镇危险房屋管理工作。承担中心城区房屋专项维修资金的审批和使用监管工作。指导监督私房政策落实。

（七）建筑业管理处。拟订建筑行业发展规划、建筑市场管理和建筑产业政策并组织实施。指导监督房屋建筑和市政基础设施工程的施工安全、质量、工程建设监理、质量检测、工程造价管理等工作。组织或参与调查处理房屋建筑和市政基础设施工程事故。参与全市建筑业行业统计工作。指导全市建筑业企业资质、中介机构资质资格、安全生产许可和从业人员资格的管理。组织推进工程质量安全标准化管理和品牌创建工作。

（八）公用事业管理处(挂园林管理局牌子）。指导城乡供排水、燃气、生活垃圾等市政公用设施一体化建设和管理。组织编制市区市政道路、园林绿化、供排水、市容环卫、城市亮化、燃气及节约用水等方面的专项规划，拟订相应的建设和管理计划。指导海绵城市建设、地下综合管廊建设。参与中心城区园林景观、市政公用设施的设计方案审查；指导协调城镇市容环境卫生管理工作；指导中心城区市容环境、市政道路、桥梁、路灯、城市排涝、园林绿化的维护（养护）管理工作并监督考核。负责中心城区城市污水处理费、超计划用水累进加价水费征收。

（九）城乡建设管理处。拟订小城镇建设管理政策并指导、监督实施；指导实施农村住房建设和危房改造；参与美丽乡村建设工作。指导监督历史名城、名镇、名村的保护工作。按照职责分工负责农村生活垃圾治理工作。负责人居环境、新型城市化及相关政策方面的研究工作。

（十）科技设计处。拟订住房和城乡建设行业的科技发展、建筑节能与绿色建筑规划和政策并指导、监督实施。指导重大建设科技项目研究开发和技术创新、引进和推广工作。拟订勘察设计咨询行业的发展规划、技术政策和规章制度并指导、监督实施；监督管理勘察设计质量，管理勘察设计咨询单位资质。负责建设工程消防设计审查、房屋建筑工程和市政基础设施工程防雷设计审核工作。

机关党委。负责机关和直属单位党的建设和群团工作。

市建设局设湖州经济技术开发区分局、湖州太湖旅游度假区分局等2个正科级派出机构，分别与湖州经济技术开发区管理委员会建设局、湖州太湖旅游度假区管理委员会建设与交通局合署办公。主要职责是：受市建设局委托，承办市级向区级下放有关事项的审批工作。参与房屋建筑和市政基础设施工程文明施工的监督工作；参与调查处理房屋建筑和市政基础设施工程事故；参与建筑施工新技术、新产品、新工艺、新材料的推广应用；参与建筑业的行业统计；参与建筑安全文明施工标准化工地创建评审；参与推进新型建筑工业化和工程总承包试点工作；承担建筑业企业三级及劳务资质的初审工作等。