（一）办公室（政务服务科）。负责文电、会务、机要、档案等机关日常运转工作。承担信息、安全、保密、信访、政务公开、政务信息化、政务服务、宣传等工作。指导全市水利信息化建设工作。督促检查水利重大政策、决策部署和重点工作的贯彻落实情况。负责本部门政务服务事项清单的编制、合法性审查与发布工作；承担本单位直接实施和上报的依申请政务服务事项办理工作，负责网上审批，推进本部门审批流程的优化工作，组织本部门行政审批制度改革和政务服务事项标准化工作。
（二）规划计划与财务科(审计科)。研究拟订水利发展规划、重要江河湖泊流域综合规划、水资源综合规划，组织制订水利专业专项规划。组织编制水利信息化规划。组织指导水工程建设项目合规性审查。承担水利投资统计工作。提出中央和省预算内水利投资、中央和省水利财政资金分解安排建议和市级水利建设资金安排建议，并指导资金使用。负责编制运转性资金预算并组织实施。承担财务管理、国有资产管理、内部审计工作。提出有关水利价格、收费、信贷的建议。承担水利资金管理使用、水利工程建设管理的审计监督及绩效评价工作。
（三）水政水资源科（市节约用水办公室）。承担实施最严格水资源管理制度相关工作，组织实施水资源取水许可、水资源论证等制度，指导开展水资源有偿使用工作。指导水量分配工作并监督实施。组织编制水资源保护规划，指导饮用水水源保护、河湖水生态保护与修复及河湖水系连通工作。组织开展水资源调查评价，编制发布市水资源公报。参与编制水功能区划和指导入河排污口设置管理。指导地下水相关开发利用、水资源管理保护、超采区综合治理。组织起草有关地方性法规、规章草案。承担有关规范性文件的合法性审查工作。指导监督水行政执法。参与行政复议，承担行政应诉、行政赔偿及普法宣传、法律顾问等相关工作。拟订节约用水文件，组织编制并协调实施节约用水规划，组织指导计划用水、节约用水工作。组织实施用水总量控制、用水效率控制、计划用水和定额管理制度。指导和推动节水型社会建设工作。指导城市污水处理回用等非常规水源开发利用。指导河湖生态流量水量管理。组织指导水资源调度工作并监督实施。组织指导水政监察工作。承担重大涉水违法事件查处。协调跨县区的水事纠纷。负责水利规费征收工作。
（四）工程建设科（水土保持科）。指导相关水利工程建设管理，组织制定有关制度并监督实施。组织指导水利工程蓄水安全鉴定及验收工作。指导江海堤围、水库、水闸、引水工程的除险加固等建设管理及验收工作。组织开展大中型灌排工程、涝区治理工程的建设与改造。指导水利建设市场的监督管理和水利建设市场信用体系建设。承担水土流失综合防治工作，组织编制水土保持规划并监督实施，组织水土流失监测、预报并公告。按权限审核开发建设项目水土保持方案并监督实施。组织实施水利工程质量和建设安全监督。
（五）运行管理与农村水利科。指导水利设施的管理、保护和综合利用。组织指导农村水利工程等的验收工作。负责相关水利工程质量和建设安全监督。组织编制水库运行调度规程，指导水库、堤防、水闸、水电站大坝、农村水电站等水利工程的运行管理与划界。组织指导水利工程管理体制改革工作。指导农村水利工作。指导农村饮水安全工程建设管理和节水灌溉。组织拟订全市农村水能资源开发的政策及开发规划，指导农村水能资源开发、农村水电站改造和水电农村电气化工作。指导农村水利社会化服务体系建设。负责实施乡村振兴战略水利保障工作。
（六）河湖管理科。承担推进河长制湖长制的组织实施具体工作。负责水域及其岸线的管理和保护工作。组织实施河道管理范围内工程建设方案审查制度，组织指导有关防洪论证工作。指导监督河道采砂管理工作，组织指导河道采砂计划的编制。指导江河湖泊、河口滩涂的开发、治理和保护工作。
（七）水旱灾害防御科（水库移民科）。组织指导编制洪水干旱防治规划、防护标准、防御洪水方案及相关应急预案并指导实施。负责监督水利工程防洪抗旱责任制落实，指导水利工程应急抢险的技术支撑工作。承担水情旱情监测预警工作。联系水文工作。组织指导水利工程抢险物资储备和工程抢险队伍建设。组织协调指导蓄滞洪区安全建设、管理和运用补偿工作。统计水利设施受灾情况，指导实施水利工程应急度汛项目。承担洪泛区、蓄滞洪区和防洪保护区的洪水影响评价工作。组织编制重要江河湖泊和重要水工程的防御洪水抗御旱灾调度以及应急水量调度方案并组织实施。承担台风防御期间重要水工程调度工作。负责水利行业领域安全生产工作，指导水库、堤防、水闸、水电站大坝、农村水电站等水利工程的安全监管。拟订移民安置政策和制度，指导全市水利水电工程移民安置管理和监督工作，组织实施水利水电工程移民安置初步验收、监督评估等制度。组织新建水库农村移民后期扶持人口核定登记。指导监督全市水利水电工程移民后期扶持管理工作。
（八）人事科。承担机关和指导直属单位的干部人事、机构编制、劳动工资和离退休人员服务等工作。指导全市水利行业人才队伍建设。承担水利体制改革有关工作。负责水利科技项目和科技成果的管理工作，组织水利科学研究、技术引进与科技推广。管理水利技术标准化工作。组织开展水利对外交流与合作。
机关党委。负责机关和直属单位的党群工作。
