环境实验室管理，包括质量管理、技术管理和行政管理三个方面的内容。行政管理为质量管理和技术管理提供基础性服务，包括管理所需的人力、物力资源等;而技术管理受质量管理的限制，须由质量管理来作支撑;质量管理则是为了达到质量目标开展的管理性活动，可以保证技术管理的正常运行，保障最终结果的真实可靠。为了获得更科学的实验结果，在环境实验室质量体系管理中务必遵循以下几方面要点。
工作人员是环境实验室的主体，因此，首先要做好环境实验室的人员管理工作。环境实验室质量体系的工作岗位，包括仪器操作员、抽样员、校准员、意见解说员和审核员，要求这些工作者都必须是持证上岗。此外，在日常工作中还应加强监督，考察工作人员的实际工作能力，包括工作人员是否按照规定操作仪器以及使用仪器的熟练程度、样品的抽取、运输和存储，是否符合样品处置要求，是否正确设置了实验环境，实验过程中是否有记录，试验结果是否经过自查等。
经过工作审核，可以进一步了解每一位工作者的专业能力，以便对其进行专门的培训和教育。具体以各级实验室和各类技术人员为单位，确立切实的培训需求，制定详实的培训计划，建立科学的培训程序，来提高工作人员的专业素养。只有确保工作人员具备专业技能，实验质量才能得到保证。另外，还要重视新进员工的培训，认真做好新员工岗前技能培训工作，确定其具备上岗资格后，才可让其正式上岗工作。
仪器设备是实验所需工具，直接关系到试验结果的准确性，因此必须加强对实验仪器设备的管理。
(一)采购仪器设备
实验室各部门工作人员要根据自身需求，确定需要购置的仪器设备的种类和数量，并将其填人申购表，分别经过部门负责人、技术负责人和最高管理人进行审批，审批通过之后方可进行采购。采购之前还必须做好评估工作，要求收集多方仪器设备供应商的资料，在此基础之上进行综合评估，制定出最优采购方案[f21
(二)核查并校准仪器设备的量值
在仪器设备投人使用之前，要先进行核查工作，核查工作需经过质量主管的批准，核查内容包括仪器设备的计量有效性、测量结果的溯源性、性能的稳定性。需要注意的是，仪器设备的核查工作，每年都要进行，因此必须做好每一次的检查记录，倘使核查的结果为仪器设备不合格，要对其进行校准。总之，要对每一项仪器设备进行建档，包括该仪器设备的名称、编号、合格证、使用说明书、维护资料、使用部门和校准情况等。
标准物质以及消耗性材料直接影响着校准工作，因此，要对其加强控制和管理，以确保实验结果的有效性。新购置的标准物质和消耗性材料要经管理员验收，验收内容包括标准物质和消耗性材料的品种、数量、有效证明和有效期，只有验收合格的才可以人库。管理员还要对标准物质和消耗性材料进行动态管理，建立资料一览表，随时更新标准物质和消耗性材料的相关资料。倘使在管理的过程中发现有分解、检测结果偏离的情况，应当立刻停止使用，并追究其所有检测结果。
样品的完整性和有效性是影响实验结果的因素之一。因此，要加强对样品的管理，包括样品的识别、采集、流转和存储等。样品采集应遵循其特定的技术规范，采用科学合理的采样方法。管理员在接收样品的时候，要认真检查其外观、体积、数量和标识，确定无异常之后对样品进行唯一性编号，此后便不可随意做改变；并且，不同的样品，宜采用不同的保存方法进行存储;在样品流转的过程中，管理员还应当填写流转单，以免样品混淆，影响实验结果。
环境设施是实验室进行实验的物质资源，对此国家有相关的规定，要求实验室合理布局，按照每一项仪器、材料或样品的特性，采取相应的隔离措施，避免交叉影响。例如，仪器设备室应该和样品处理室相隔离，恒量分析室应该和常量分析室相隔离，测试室应该和办公室相隔离。同时，每一个实验室的环境还应配合自身采光、通风条件，配置所需设施，以满足标准方法和仪器设备使用的要求。
