评估主体是指负责建立评估方法，对特定评估对象开展环境绩效评估的机构。主要的评估主体包括公共管理部门(政府机构)、商业部门(企业)、第三方机构(研究机构、审计机构和非政府组织等)。不同的评估主体对于环境绩效的评估侧重点也不相同。管理部门由于负责全面的环境保护工作，因此着重关注各级行政区(省级、市级、县级)以及重点流域(区域)的环境绩效情况；另外，管理部门从宏观上偏重于对环境要素的管理(如水、大气、土壤、噪声等)。随着经济社会发展和政府治理理念转型，第三方评估由于其客观和公正性，越来越受到重视。
环境绩效评估对象的范围比较广泛，从大的角度来说评估对象主要分为实体和非实体两大类。实体主要包括可能造成环境影响的组织，如企业、管理部门甚至是个人等。非实体主要包括对环境造成影响的法律法规、政策、技术规定、标准等非实体要素在实施后会对环境产生的影响。由于两大类评估对象本身的特点所决定，在具体的环境绩效评估过程中，其会侧重不同的角度：例如，实体评估对象的评估内容一般会包括污染物排放、环境质量、生态污染状况与修复情况，水、气、土、声等各类自然资源的使用情况，污染事故发生及处置情况等；非实体评估对象的评估内容主要包括环境管理效率、政策执行效果和环境影响情况等 。
