据2019年3月珠科院官网资料显示，珠科院设有博士后科研工作站，制定了《珠科院博士后科研工作站管理暂行办法》等制度，建立了8个博士后培养团队，7个研究方向，共有在站博士后3名 。佛山南海里水试验基地建有博士后科研工作楼，共5层，总面积8000多平方米，配备有办公室、实验室、会议室、饭堂。建有博士后公寓楼，共2层，28间，总面积近1000平方米，拥有网络、空调、独立洗手间等生活设施，另有管理员负责公寓的管理和保洁。
珠科院与华南理工大学于2004年联合申报硕士点成功，培养研究生近百名。2011年，珠科院被确定为河海大学研究生培养基地，已培养研究生30余名。此外珠科院还为中山大学、中国海洋大学、武汉大学、上海交通大学、暨南大学、华北水利水电大学等高校联合培养研究生15名。拥有研究生指导老师31名，在基地研究生18名 。
