据2019年3月珠科院官网资料显示，珠科院先后拥有环境监理资质（乙级）（农林水利、交通运输） ，生产建设项目水土保持监测单位水平评价证书 ，工程咨询单位资格（甲级）（水利工程、港口河海工程） ，水文、水资源调查评价资质（甲级） ，工程咨询单位资格（乙级）（生态建设与环境工程） ，建设项目水资源论证资质证书（甲级） ，质量管理体系认证证书 ，环境影响评价资质（乙级） ，计量认证证书 ，水利工程质量检测单位资质（岩土工程甲级、混凝土工程甲级、金属结构甲级、机械电气甲级、量测甲级） ，地质灾害危险性评估单位（丙级） ，水保方案编制证书（3星） ，地质灾害治理工程设计单位（丙级） ，测绘资质（乙级） ，辐射安全许可证 ，土地规划证机构等级证书（乙级） ，广东省环境污染治理资格行业认定证书（废水乙级、污染修复乙级） ，工程勘察资质（工程勘察专业类（水文地质勘察）乙级） ，广东省安全技术防范系统设计、施工、维修资格证 等各类证书。
