Ingram于1987年就提出了生态水文学概念，并于1992年Dublin国际水与环境大会正式提出生态水文学作为一门独立的边缘性学科，而中国学者开始采用生态水文学概念，开展生态水文学相关的独立研究活动已经是进入21世纪以后的事情了。

可查的国内大陆学者关于生态水文学介绍方面的第一篇中文文献是王根绪等在《地球科学进展》16卷第3期发表的《生态水文科学研究的现状与展望》。与国际上对于生态水文学的讨论一样，对于该新的学科的定义和争论一直持续。

在争论进行的同时，采用生态水文学的方法和理论开展针对东北湿地生态系统、湖泊生态系统、西北干旱半干旱和寒冷地区生态水文学的研究正在积极开展，并取得了良好的成果。从研究的内容方面而言，不仅开展了流域为单元的生态水文学研究，而且对于生态水文过程的分析也进行的更加深入，不仅开展了植被动态与生态水文关系的研究而且对于林地土壤大孔隙特征与森林生态水文关系的研究也在进行。不过，就开展生态水文学研究的空间区域和生态系统类型而言，在中国的热带、亚热带地区森林和疏林生态系统中开展生态水文学研究的还未见报道。