生态综合体的每种功能有其特定的运行规律，它将不同产业链与时间段的功能组织在一起，使其各部分的活动组织有序，共生共赢，使其保持繁荣昌盛，提高了生态综合体的使用效益。主要功能如下：

1.生态保育：生态保育Ecosystem Conservation，是以保护地球上的生物单一物种群体单位，乃至数个生物所依存的栖地，至扩展至整个生态系统维护，甚至栖地原住民文化维护的学门。生态保育主要是以生态学的观点出发，结合其它学门的技术已进行对于生态系统的维系，“保育”二字其实包含 “保护（protection）”与“复育（restoration）”这两个内涵，前者是针对生物物种与其栖息地的保存与维护，而后者则是针对濒危生物的育种、繁殖与对退化生态系统的恢复、改良和重建工作。由于生态保育关系到人类对于生物行为、食物链乃至整个栖地环境的了解也关系到人类在环境经营上的模式与对于自然资源的利用和保护，因此生态保育需要众多的学门参与，诸如生态学、生物学、地质学、土壤学、地理学、物理学、化学、土木工程、经济学、管理学、公共卫生、环境科学等学门都是生态保育上所需顾及到的层面。

2.生态农业：生态农业——是指在保护、改善农业生态环境的前提下，遵循生态学、生态经济学规律，运用系统工程方法和现代科学技术，集约化经营的农业发展模式，是按照生态学原理和经济学原理,运用现代科学技术成果和现代管理手段,以及传统农业的有效经验建立起来的，能获得较高的经济效益、生态效益和社会效益的现代化农业。

3.绿色工业：绿色工业是指的是实现清洁生产、生产绿色产品的工业，即在生产满足人的需要的产品时，能够合理使用自然资源和能源，自觉保护环境和实现生态平衡。其实质是减少物料消耗，同时实现废物减量化、资源化和无害化。因为一切工业污染都是因为工业生产过程中对资源利用不当或利用不足所导致。

3.生态旅游：生态旅游以有特色的生态环境为主要景观的旅游。是指以可持续发展为理念，以保护生态环境为前提，以统筹人与自然和谐发展为准则，并依托良好的自然生态环境和独特的人文生态系统，采取生态友好方式，开展的生态体验、生态教育、生态认知并获得心身愉悦的旅游方式。