（1）水资源匮乏，生产用水严重挤占生态用水，生态环境持续恶化
石羊河流域深居大陆腹地，属大陆性温带干旱气候，降水稀少，水资源匮乏。平原区年降水量仅150～300毫米，下游地区更小于150毫米，而年蒸发量却高达1300～2600毫米，蒸发量远大于降水量，干旱指数最高达52以上。近20年来，全流域人口增加了33%，农田灌溉面积增加了30%，粮食产量增加了45%，国内生产总值（GDP）翻了约6倍，而水资源量不但没有增加反而减少了约1%，水资源供需矛盾十分尖锐。人们为了发展经济，过度开发水资源，严重挤占生态用水，导致流域生态环境急剧恶化。民勤盆地现状绿洲面积约1313 平方公里，比50年代减少了289 平方公里。现状全流域年超采地下水量达4.32亿立方米，其中民勤盆地超采2.96亿立方米，其北部湖区生态已濒于崩溃，“罗布泊”景象已经局部显现，部分群众不得不移居他乡，沦为生态难民。
（2）区域用水不平衡加剧，不利于构建和谐社会
流域经济和社会发展没有充分考虑流域水资源的整体承载能力及区域的平衡性，总用水和耗水规模偏大，中下游水资源配置不尽合理。
六河中游天然年径流量均值为13.7亿立方米。多年来，中游灌溉面积持续扩大，大中小企业迅猛发展，耗水量猛增。据统计，中游灌溉面积由解放初期的165万亩，增加到2003年的约278万亩，增长了1.7倍。总耗水量由解放初期的5.67亿立方米增加到2003年的约10亿立方米，增加近2倍，尤以农业耗水量增加为甚。由于中游地区耗用水量过大，致使进入下游民勤盆地可供消耗的水量不足1.0亿立方米。中下游用水矛盾十分尖锐，不利于构建和谐社会。
（3）用水结构不合理，水资源利用效率偏低
在水资源如此紧缺的背景下，流域用水结构极不合理，长期徘徊在以农业灌溉为绝对成分的水平。2003年国民经济各行业总用水量28.77亿 立方米，其中农田灌溉用水比例高达86%，工业用水比例仅5.4%。全流域单方水国内生产总值（GDP）仅为4.81元，是全国平均水平的约1/5，水资源利用效率偏低。
（4）山区水源涵养林萎缩，水土流失严重，出山径流变幅加剧
流域上游祁连山区由于人为砍伐森林，过度放牧，开矿挖药和开荒种植，近1500平方公里的林草地被垦殖，水源林仅存不足550 平方公里。现有乔木林644 平方公里、灌木林1832 平方公里，山区的植被覆盖率只有40%左右，植被破坏严重，水源涵养能力降低。祁连山灌木林线的上移和灌木林的草原化、荒漠化，造成的结果是保水能力减弱，调节功能降低，水土流失面积增大，大量泥沙及漂砾随洪水而下，淤积河床、水库及渠道，全流域上游山区的十多座水库程度不同地均有淤积，有效库容减少1/5～1/8。出山径流年内丰枯幅度八十年代以后较五六十年代增大30%，部分水库的调节能力已不能满足河川径流的变化需求。
（5）水污染严重，进一步加剧水资源危机
随着经济快速发展和城镇化趋势的加大，流域中游地区城市废污水排放明显增加，现状金昌市废污水排放量约为3364.42万吨，武威市约为2471.47万吨。石羊河干流河流地表流量小，流程短，河道自净能力弱，环境容量小，纳污量十分有限，造成进入下游地表水水质严重污染。现状红崖山水库水质基本为Ⅴ类或劣Ⅴ类。民勤地下水质随着中游地表水水质恶化，加上当地城市污水及地表各种污染物的渗漏也受到不同程度的污染。民勤盆地北部（泉山北部及湖区）地下水质已明显恶化，且呈快速南侵之势。湖区大部分地下水因矿化度高，不仅人畜不能饮用，而且也无法用于农田灌溉。水质恶化进一步加重了下游水资源危机和日趋严重的生态问题。
民勤盆地尤其其北部地下水矿化度的升高，主要是因为民勤盆地位于流域尾闾，本身就是整个流域的盐分容泄区, 加上民勤盆地长期大量提取地下水灌溉，反复蒸发浓缩，致使地下水盐分浓度不断升高，这是内陆河尾闾水质演变不可避免的自然规律。民勤盆地大规模的人类活动进一步加剧了这种演变趋势。
（6）水资源统一管理严重缺位
流域内水资源缺乏统一管理和调度，各自为政现象严重，造成无序开发水土资源和开采地下水。
下游民勤地区几十年来过量开垦耕地，严重超采地下水。据统计，民勤上世纪八十年代中期全县灌溉面积60多万亩，进入九十年代在“瓜籽热”的经济利益驱动下，耕地开荒处于无序状态，灌溉面积最高峰时期曾达到120～130万亩左右。随着瓜籽行情的低落，大量耕地被撂荒和弃耕，目前民勤县的灌溉面积维持在100万亩左右。现状超采地下水量维持在4.0亿立方米以上。地表水的供给严重不足、地下水的掠夺性开采、地下水位的持续下降和地下水水质的恶化，导致新一轮的土地撂荒，民勤绿洲已面临十分严重的水资源危机和生存危机。
规划原则
（1）统筹城乡协调发展，加快经济结构的战略性调整，坚持改善生态与提高农民收入相结合，促进人与自然和谐相处、区域经济社会可持续发展。
（2）以水权管理为核心，加强水资源统一管理、统一调度，节约用水和提高用水效率相结合，合理配置水资源，提高水资源承载能力，建立健全水资源高效管理体制和运行机制。
（3）坚持综合规划，统筹兼顾，标本兼治，综合治理，突出重点，因地制宜，分步实施。
（4）坚持控制灌溉面积与降低灌溉定额相结合，以降低定额为重点；渠系节水与田间节水相结合，以田间节水为重点；工程节水与管理节水相结合，管理优先；常规节水与高新节水相结合，积极发挥高新节水的示范作用；农业节水与综合节水相结合，推动流域全面节水。
（5）政府引导与农民意愿相结合，充分发挥农民的主体作用，让农民真正享有知情权、参与权、管理权、监督权。
（6）工程与非工程措施相结合，生态效益、经济效益与社会效益相统一，采取综合措施，实施重点治理。
