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学院拥有1个结构工程国家重点(培育)学科,1个土木工程新技术与防灾减灾“211工程”国家重点学科建设项目,结构工程、桥梁与隧道工程和岩土工程等3个福建省重点学科。已有土木工程一级学科博士点及博士后科研流动站,拥有结构工程、桥梁与隧道工程、岩土工程、市政工程、防灾减灾与防护工程、水工程安全与水灾害防治、供热供燃气通风及空调工程等7个二级学科博士点,以及8个二级学科硕士点。