国家级重点学科（1个）：植物病理学
国家级重点（培育）学科（1个）：作物遗传育种
农业部重点学科（2个）：植物病理学、作物遗传育种
国家林业局重点学科（1个）：森林培育
福建省省级重点学科（21个）：植物保护、作物学、林学、农业资源与环境、园艺学、农林经济管理、林业工程、生物学、食品科学与工程、生态学、风景园林学、畜牧学、兽医学、马克思主义理论、农业工程、公共管理、环境科学与工程、统计学、交通运输工程、机械工程、工商管理
福建省特色重点学科（9个）：林学、园艺学、农林经济管理、林业工程、生物学、生态学、食品科学与工程等。
