1992年至1999年。根据房屋建筑设备工程（水电设备工程）专科专业的需要，先后建立了“通风空调实验室”、“水电实习馆”、“金工实习馆”等实验室，满足了学生对建筑设备安装实训和实验的要求，提高了学生水电安装技术和技能。

1999年至2002年。在水电设备工程的建筑给排水方向基础上，增设了环境工程专科专业。环境工程专业对实验室建设提出了新的要求，在此期间建设了水污染控制实验室、流体力学实验室、化学基础实验室等专业和基础实验室。至2002年底，学校已投入设备经费约197.6万元，建立了水电实训中心、化学基础实验室，环境监测实验室、流体力学实验室和水污染控制实验室。

2003年至2007年。2004年随着环境工程、给水排水工程本科专业的设立，中心进入快速发展期。2004年对实验室体制进行了改革，通过整合学校和系内教学资源成立了本中心。中心实行主任负责制，人、财、物统一管理，并对实验教学人员进行了优化。2004年至2005年，利用学校第二期基础实验室改造资金，投入104.8万元资金，购进了配套设备，更新和修改了部分实验项目，新建了微生物实验室、固体废弃物实验室和室内环境实验室，扩建了化学基础实验室和流体力学实验室。重点对实验内容体系进行改革，增加了创新性、综合性和设计性实验，部分实验室实行开放教学，实验教学水平明显提高。2005年底，环境工程被列为福建工程学院首批重点建设学科，这标志着初步形成了环境类实验教学体系和学科体系。2006年4月，“绿色环境节能材料研究中心”成立，合作企业先后投入108万元，用于固废实验室软硬件建设。在省内外10多家企业建立实习基地，形成了产、学、研联合共建培养应用型人才的办学模式。2006年至2007年，利用重点学科建设的机会，继续投入232.4万元，购进了部分较先进的仪器设备，重新修订了实验教学大纲，实验课与理论课相对独立。在进一步更新实验项目的同时，加强了综合性、设计性、创新性实验的开设，加大实验室开放力度，加强了实验室的规范化管理。

2008至今。2008年1月，依托中心建立的“福建省高等学校绿色节能环境材料工程研究中心”被省教育厅批准成立，投入120万元用于实验室建设（包括学校配套90万元），目前已初见成效。2008年6月，环境工程学科被学校授予学校重点学科。2009年“节能与环保技术研究及创新平台建设”高校服务海西建设重点立项，福建省和学校5年内投入1000万元，重点用于科技创新平台建设。2009年8月，中心将完成实验室整体搬迁，新校区8000平米新实验室将正式投入使用。