如上所述，物流合同的内容具有广泛性和复杂性，物流合同涉及运输、储存、装卸、搬运、包装、流通加工、配送、信息处理等诸多环节，同时由于第三方物流经营者拥有的资源不同，经营特色和经营方式也多样化，第三方物流合同当事人之间的法律关系也变得复杂起来。

从第三方物流合同主体来看，一方面是物流服务提供者（物流经营者）与物流服务需求者（物流客户）的关系，双方基于物流服务合同的约定或法律的规定享有权利并承担义务，同时也必须独立地承担民事责任。另一方面是物流经营者与物流活动实际履行者的关系，当物流经营者利用自身的物流经营资源独立完成物流服务的全部过程时，物流经营者与物流活动的实际履行者是相同的，法律关系相对较为简单，但第三方物流合同的主体往往是综合的物流服务合同，每个物流经营者拥有的资源不同，因此，实践中物流经营者在接受物流客户的委托后，往往与一个或多个实际履约方分别签订合同，委托他们从事具体的运输、仓储、加工、包装、装卸等服务。

从第三方物流合同的内容和性质来看，不管是物流服务提供者（物流经营者）与物流服务需求者（物流客户）的关系，还是物流经营者与物流活动实际履行者的关系，根据不同的合同约定和物流实践，比较常见的几种法律关系是：

一般物流服务法律关系

物流最主要目的是通过运输链的顺利衔接，实现物质资料从供给者到需求者的物理移动最优化，所以运输、仓储、装卸、搬运等活动仍然是整个物流活动的核心要素。当第三方物流企业接受客户的委托，自己进行运输、仓储、装卸、搬运等物流作业活动，自己完成物流合同所约定的内容时，这种经营模式与传统运输业、仓储业等区别不大，当事人双方形成相应的法律关系，如运输法律关系、仓储法律关系等。在物流实践中，物流仓库及相关设施可以通过自建或租赁取得，如果租赁取得，其实质是一种租赁行为。如果物流经营者在经营物流服务时接受货主的委托，根据运输、销售或消费使用的需要进行包装、分割、计量、分拣、刷标志、组装等简单作业，或者对委托托运的货物进行包装、集装箱拼箱、装箱或者拆箱，这种行为具有加工承揽的性质，物流经营人此时具有承揽人的法律地位，则形成相应的加工承揽法律关系。

委托代理法律关系

物流企业不可能拥有履行物流合同的所有资源，因此不可避免地在第三方物流合同中约定物流经营者在一定权限内可以物流需求者的名义委托第三方完成物流业务，这时物流合同的当事人之间就形成了委托代理关系，即第三方物流经营者以物流需求者的名义同第三人签订分合同，履行物流合同的部分内容，对该分合同的权利、义务，物流需求者也应享有和承担。另外，物流经营者也常常接受货主的委托，以货主的名义办理货物的报关、报验、保险、结汇等业务，此时物流经营者除了和物流需求者之外，还以货主的名义与海关、商检、动植物检疫、保险公司、银行或其他有关第三方发生法律关系。

居间或者行纪法律关系

在实际业务操作中，物流经营者可能提供与运输有关的信息、机会等服务，促成物流需求方与物流提供方（如货主与承运人、港口经营者等）之间的交易，从中收取一定的费用和报酬，并协调有关当事方的利益，而自己并没有同任何一方签订委托代理合同或向任何一方提供实体物流服务，此时，物流经营者处于居间人的法律地位。

实践中，也有物流经营者在为货主提供运输代办服务时，由于没有运输工具，就以自己的名义与第三方签订运输合同或者租用第三方的运输工具；由于没有仓库，就以自己的名义与第三方签订仓储合同或者租用第三方的仓库，此时，物流经营者处于行纪人的法律地位。

需要指出的是，实践中许多物流活动的当事人并不能清楚区分委托代理、居间、行纪的不同，这几种法律关系具有一定的相似之处，都是一方为他方办理事务、提供服务或劳务性质的合同，但他们在合同法中各自属于独立的有名合同，有其不同的地方，其主要区别是在代理关系中代理人只能在代理权限内以被代理人的名义与第三人进行交易活动，后果由被代理人承担；居间人则仅仅为他人提供交易机会和信息媒介服务，并不参与他人的合同交易行为；行纪则是行纪人以自己的名义为委托人进行交易活动。