根据流程优化的基本原则“以流程为导向，以顾客为导向，重视信息技术的支持”，系统改造法的实施方法大致上可以分为：

1、创新

创新是流程优化的第一个方法，反映了一体化的本质。流程创新包括流程创新和管理创新。从流程的概念分析，流程的创新可进一步分为流程活动的创新、流程逻辑的创新和流程实现方式的创新。从管理的要素分析，管理创新包括管理观念的创新、管理方法的创新、管理方式的创新和管理手段的创新等方面。

2、消除

消除主要指的是对流程内的非必要非增值性的流程或活动予以清除。以单体物流流程来说，存在相当多由环境、条件改变和流程设计不合理所造成的非增值性流程或活动。一般来说，它们主要包括：

过量产出；

活动间的等待；

迂回运输和对流；

不必要的加工；

过量的库存；

反复性检验；

跨部门的协调。

3、简化

在尽可能清除了非必要非增值性的环节以后，对剩下的活动仍应该进一步简化，所有的流程都应该基于情况和条件的变化而变化，以提高流程的运作效率，而原有的流程是基于当时环境来设计，改变简化成为维持其运作的基础。