银行会计制度是规范银行会计行为的准则。会计制度不健全或有章不循，执行不力就会发生会计风险。外部风险主要表现在金融诈骗、政策性亏损给银行造成的损失；内部风险由会计主体主观和客观因素引发。银行支付结算风险已渗透到银行会计结算工作的各个环节，其表现形式也呈多样化。
1清算风险
清算风险是银行在清算同城票据交换资金或系统内联行资金过程中产生的风险。一些商业银行在资金管理、业务开展、人员调配、财务核算等方面没有进行有效的管理与培训，一些银行工作人员工作责任度不够高。清算专业人员实行任职资格审查制度不到位。一些商业银行忽视支付清算人员的培训，缺乏对会计人员政治思想教育和法制教育。这些导致了清算风险的产生，主要表现为两大类：第一，个别行、社在同城结算和联行清算环节上控制不严所产生的风险；第二，商业银行将资金矛盾转化为结算矛盾，利用联行体系的关联性而导致的地区性支付风险。
2票据风险
结算业务是通过银行提供各种支付结算的手段与工具，为客户实现经济活动中的货币给付转移。只有商业银行产生对票据的需求，才能完成对资金的供给，否则交易无法实现。票据业务岗位职责不明确，重点岗位监督管理以及内部检查不严，对内部违规发展票据业务缺乏有效监督，甚至采取默许的态度。随着经济活动的日益频繁，支付业务逐渐增加，以票据为主要支付手段的结算业务也给银行带来了诸多的风险。
3结算操作风险
商业银行支付结算操作风险意识淡化，政治思想工作薄弱。从银行会计结算部门内部发生的各类案件中不难发现，有章不循、违章操作是发案的根本原因。一些基层分支机构人手配备不足或随意抽调会计人员应付紧急任务，使结算业务相互制约机制不落实、出现真空或漏洞，被犯罪分子伺机作案。操作监督检查流于形式，上级对下级、主管对基层人员、事后监督岗对会计操作岗的各项检查并未严肃认真进行，而是成了例行公事，导致一些支付结算案件长期隐藏。
4内控风险
人员配备不到位、规章制度形同虚设，特别是一些基层分支机构人手配备不足或随意抽调会计人员应付紧急任务，使业务相互制约机制不落实、出现真空和漏洞，被犯罪分子伺机作案。监督检查流于形式，上级对下级、主管对基层人员、事后监督岗对会计操作岗的各项检查并未严肃认真进行，而是成了例行公事、使一些内部案件长期暴露不了。
5经营风险
经营风险是指银行由于经营管理不善，各种风险积聚到一定程度集中表现为流动性困难而引发的支付风险。随着市场经济的发展和金融业竞争的加剧，银行经营面临内外双重压力。银行自我约束机制和内部控制机制尚未真正建立，经营管理水平难以适应市场的变化，出现大量违规经营，信贷资产质量下降，不良资产比例上升，政府行政干预和企业借改制之机悬空银行债务，使银行经营状况进一步恶化，资产安全性和流动性出现严重问题，有的已发生支付危机。与此同时有效化解和抵御风险机制尚未建立。当前影响银行资产流动性、安全性的主要因素是金融资产质量低下、资产负债比例高、金融资产风险大。
