1952年，哈尔滨工业大学、清华大学、同济大学首批开设给水排水工程专业，是给排水科学与工程的前身 。

1970年起，中国部分高校陆续恢复因“文革”期间停止的给水排水工程专业招生。清华大学、同济大学、兰州铁道学院、北京工业大学、重庆建筑工程学院、湖南大学、哈尔滨建筑工程学院、太原工学院、西安冶金建筑学院（现西安建筑科技大学）、天津大学、武汉建材学院（现武汉理工大学）、辽宁建筑工程学院（现沈阳建筑大学）等共招生2000余名 。

1993年，在中华人民共和国国家教育委员会印发的《普通高等学校本科专业目录新旧专业对照表》中，给水排水工程专业代码由“工科1111”调整为“080808”，专业类别为土建类 。

1996年，中国有48所学校开办给水排水工程专业，已达到一定的办学规模 。

1998年，在中华人民共和国教育部印发的《普通高等学校本科专业目录新旧专业对照表》中，给水排水工程专业代码由“080808”调整为“080705”，专业类别任为土建类 。

2012年，在中华人民共和国教育部印发的《普通高等学校本科专业目录新旧专业对照表》中，给排水科学与工程（专业代码：081003）由给水排水工程（专业代码：080705）和给排水科学与工程（专业代码：080711W）合并而来 。

2020年2月，在中华人民共和国教育部印发的《普通高等学校本科专业目录（2020年版）》中，给排水科学与工程专业隶属于工学、土木类，专业代码：081003 。